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Matthew Richards authored on 03/10/2017 16:42:17
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inst/scripts/import/jaspar2016/sample.pcm
History View file @ b7fe234
1 1 
deleted file mode 100644
... ... 
@@ -1,7254 +0,0 @@
1 
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2 
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3 
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4 
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5 
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6 
-
7 
->MA0001.2	AGL3
8 
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9 
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10 
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11 
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12 
-
13 
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14 
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15 
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16 
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17 
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18 
-
19 
->MA0002.2	RUNX1
20 
-A  [ 287  234  123   57    0   87    0   17   10  131  500 ]
21 
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22 
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23 
-T  [ 521  814  656 1936   53 1716   13   93 1339 1325 1053 ]
24 
-
25 
->MA0003.1	TFAP2A
26 
-A  [  0   0   0  22  19  55  53  19   9 ]
27 
-C  [  0 185 185  71  57  44  30  16  78 ]
28 
-G  [185   0   0  46  61  67  91 137  79 ]
29 
-T  [  0   0   0  46  48  19  11  13  19 ]
30 
-
31 
->MA0003.2	TFAP2A
32 
-A  [1387 2141  727 1517   56    0    0   62  346 3738  460    0  116  451 3146 ]
33 
-C  [1630 1060 1506  519 1199 5098 4762 1736 2729  236    0    0 1443 3672  690 ]
34 
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35 
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36 
-
37 
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38 
-A  [1706  137    0    0   33  575 3640 1012    0   31 1865 ]
39 
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40 
-G  [ 277 4340  139   11  658 1613  618 5309 5309  582 1295 ]
41 
-T  [1386   47    0  281 2972  438   56    0    0   21 1350 ]
42 
-
43 
->MA0004.1	Arnt
44 
-A  [ 4 19  0  0  0  0 ]
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46 
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48 
-
49 
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50 
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51 
-C  [87 86  9  5  1  3 16 13  0  0 25 ]
52 
-G  [ 2  0  7  2  1  4 17 26 64 82  9 ]
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-
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56 
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57 
-C  [20  3  0  8 66 65  3  2  0  0 15  8  0  0 17  4  6 10 ]
58 
-G  [ 6  3  1  8  0  0  6  0  1  1 11 20 57 54  5  5  9 16 ]
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60 
-
61 
->MA0006.1	Ahr::Arnt
62 
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63 
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-
67 
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68 
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69 
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70 
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71 
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72 
-
73 
->MA0007.2	AR
74 
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75 
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76 
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77 
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78 
-
79 
->MA0007.3	Ar
80 
-A  [1094  939    8 1197 2167    4 1997  199  561  755   33    0   22 1195    7   32  430 ]
81 
-C  [ 167   17    0  291    5 2189   20 1228  611  250  277    4    4  112 2166 1542 1092 ]
82 
-G  [1555 2221 3837  184    3    5  273  328  991 1673    8 3618    0  230    0    2  343 ]
83 
-T  [ 286   19    6 1027    3    2   11  712  509  207 2529    1 2768 1094    8  829  913 ]
84 
-
85 
->MA0008.1	HAT5
86 
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87 
-C  [13  1  0  0  5  0  0  0 ]
88 
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90 
-
91 
->MA0008.2	HAT5
92 
-A  [ 1  4  3 22 25  0  0 25  0  0  3  2 ]
93 
-C  [ 5  5 13  1  0  0  5  0  0  0  1  8 ]
94 
-G  [ 3  3  4  0  0  0  0  0  0  0 12  4 ]
95 
-T  [10 10  3  1  0 25 20  0 25 25  0  1 ]
96 
-
97 
->MA0009.1	T
98 
-A  [ 2  1 40  0  0  0  0  0  1 40 31 ]
99 
-C  [28  1  0  0  0  0  0  2  7  0  5 ]
100 
-G  [ 8  0  0 40 40  0 40  0 28  0  0 ]
101 
-T  [ 2 38  0  0  0 40  0 38  4  0  4 ]
102 
-
103 
->MA0009.2	T
104 
-A  [  52 2241 3816    0 4107  218 2277  629 4161 1066  665    0   12  504  373 4171 ]
105 
-C  [ 156 4778   55 5262    0 5104 4418  611  121 2004  135  190    0 2352 1237   12 ]
106 
-G  [  22 1321 1415    0  141  111 1667  214  491 5819 7304   13 7628   69 7058  111 ]
107 
-T  [6886  254  217    2    0  400  809 6551  417 2921  366 6777    0 5975 1657   17 ]
108 
-
109 
->MA0010.1	br
110 
-A  [3 1 5 7 3 6 4 7 1 9 8 5 4 2 ]
111 
-C  [1 1 2 0 0 0 1 0 8 0 0 0 0 3 ]
112 
-G  [4 1 1 1 0 0 4 1 0 0 1 3 0 2 ]
113 
-T  [1 6 1 1 6 3 0 1 0 0 0 1 5 2 ]
114 
-
115 
->MA0011.1	br(var.2)
116 
-A  [ 3  5  0  0 12  1  2  1 ]
117 
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118 
-G  [ 1  1  0  0  0  2  1  1 ]
119 
-T  [ 7  4  2 11  0  8  9  8 ]
120 
-
121 
->MA0012.1	br(var.3)
122 
-A  [ 3  9 10 12  0  4 10  6  6  4  2 ]
123 
-C  [ 1  2  0  0 10  0  0  0  1  3  3 ]
124 
-G  [ 1  1  0  0  1  0  0  4  2  2  5 ]
125 
-T  [ 7  0  2  0  1  8  2  2  3  3  2 ]
126 
-
127 
->MA0013.1	br(var.4)
128 
-A  [1 4 2 1 5 6 5 1 3 5 3 ]
129 
-C  [1 0 0 0 0 0 0 3 0 0 1 ]
130 
-G  [0 0 4 0 1 0 1 1 1 0 0 ]
131 
-T  [4 2 0 5 0 0 0 1 2 1 2 ]
132 
-
133 
->MA0014.1	Pax5
134 
-A  [ 4  4  4  1  2  7  2  0  1  6  6  0  2  3  1  6  5  2  2  5 ]
135 
-C  [ 1  0  3  2  7  2  5  3  2  1  0  0  8  0  0  1  1 10  5  0 ]
136 
-G  [ 4  8  3  5  1  1  3  2  8  3  2 12  1  9  4  5  5  0  5  6 ]
137 
-T  [ 3  0  2  4  2  2  2  7  1  2  4  0  1  0  7  0  1  0  0  1 ]
138 
-
139 
->MA0014.2	PAX5
140 
-A  [261 315 308 245   0  39 766 152   9 174 542 537   0   3 317 153 225 587 152 ]
141 
-C  [228  59  30 148 169 736  21 163 538 419   8  17 215 751  17  41   6  33 667 ]
142 
-G  [333 222 546 336 455   0  83 533  35 294 344 185 679  17 540 155 659 222  25 ]
143 
-T  [ 74 300  12 167 272 121  26  48 314   9   2 157   2 125  22 547   6  54  52 ]
144 
-
145 
->MA0015.1	Cf2
146 
-A  [25  1 74  0 78  1 41  2 53 12 ]
147 
-C  [13  2  2  9  2  4  2  9  3 29 ]
148 
-G  [40  1  4  4  0  1 36  1 20 15 ]
149 
-T  [ 2 76  0 67  0 74  1 68  4 24 ]
150 
-
151 
->MA0016.1	usp
152 
-A  [ 0  1  0  0  0  0 35  5  5  6 ]
153 
-C  [ 1  0  0  0  0 36  0 25  8 10 ]
154 
-G  [37 36 38 38  0  1  3  3 22 16 ]
155 
-T  [ 0  1  0  0 38  1  0  5  3  6 ]
156 
-
157 
->MA0017.1	NR2F1
158 
-A  [ 0  1 12  6  0  0  0  1  2  6  6  1  3  0 ]
159 
-C  [ 0  0  0  7 13  3  2  0  0  4  5 10  6  3 ]
160 
-G  [ 2 12  1  0  0  0  0  0 11  3  1  1  0  3 ]
161 
-T  [11  0  0  0  0 10 11 12  0  0  1  1  4  7 ]
162 
-
163 
->MA0017.2	NR2F1
164 
-A  [ 4802  7266  6333  8496     0     0     0     0 12059  5116  3229  3276  5681 ]
165 
-C  [11446  1692   387     0    30     0     0 12059     0  3055  2966  2470  2912 ]
166 
-G  [ 3276  1153  4869  3791 12059 12059     0     0    91  1618  4395  3886 36863 ]
167 
-T  [ 3980  1948   469     0     0     0 12059     0     0  2270  1469  2427  3466 ]
168 
-
169 
->MA0018.1	CREB1
170 
-A  [ 0  3  0  2  5  0  0 16  0  0  1  5 ]
171 
-C  [ 7  5  3  3  1  0  0  0 16  0  5  6 ]
172 
-G  [ 5  4  6 11  7  0 15  0  0 16  0  3 ]
173 
-T  [ 4  4  7  0  3 16  1  0  0  0 10  2 ]
174 
-
175 
->MA0018.2	CREB1
176 
-A  [ 0  0 11  0  1  0  2  8 ]
177 
-C  [ 1  1  0  9  0  3  7  0 ]
178 
-G  [ 1 10  0  2 10  0  1  1 ]
179 
-T  [ 9  0  0  0  0  8  1  2 ]
180 
-
181 
->MA0019.1	Ddit3::Cebpa
182 
-A  [14 11 18  0  0  4 38 36  0 14  4  0 ]
183 
-C  [ 7  7  3  1  0 33  1  2  6 17 23 26 ]
184 
-G  [12 14 15  0 38  0  0  1  0  5  9  6 ]
185 
-T  [ 6  7  3 38  1  2  0  0 33  3  3  7 ]
186 
-
187 
->MA0020.1	Dof2
188 
-A  [21 21 21  0  3  7 ]
189 
-C  [ 0  0  0  0 14  6 ]
190 
-G  [ 0  0  0 21  2  3 ]
191 
-T  [ 0  0  0  0  2  5 ]
192 
-
193 
->MA0021.1	Dof3
194 
-A  [21 21 21  0  0  6 ]
195 
-C  [ 0  0  0  0 10  6 ]
196 
-G  [ 0  0  0 21  3  9 ]
197 
-T  [ 0  0  0  0  8  0 ]
198 
-
199 
->MA0022.1	dl
200 
-A  [ 0  0  0  0  1  1  1  0  0  1  1  3 ]
201 
-C  [ 5  0  1  0  1  0  0  0  3  9  9  5 ]
202 
-G  [ 6 12 11 10  3  2  0  0  0  0  1  5 ]
203 
-T  [ 2  1  1  3  8 10 12 13 10  3  2  0 ]
204 
-
205 
->MA0023.1	dl(var.2)
206 
-A  [0 0 0 0 4 2 0 0 0 1 ]
207 
-C  [1 0 0 0 1 1 0 1 9 8 ]
208 
-G  [7 7 9 8 0 0 0 0 0 0 ]
209 
-T  [1 2 0 1 4 6 9 8 0 0 ]
210 
-
211 
->MA0024.1	E2F1
212 
-A  [ 0  0  0  0  0  0  0  0 ]
213 
-C  [ 0  0  0  4  2 10  0  9 ]
214 
-G  [ 0  0  0  6  8  0 10  1 ]
215 
-T  [10 10 10  0  0  0  0  0 ]
216 
-
217 
->MA0024.2	E2F1
218 
-A  [ 259  218  144    0    0    0    0    0 1059  508  305 ]
219 
-C  [ 317    0  274    0 1059    0  337  286    0    0  269 ]
220 
-G  [ 280  628  641 1059    0 1059  722  773    0  551  485 ]
221 
-T  [ 203  213    0    0    0    0    0    0    0    0    0 ]
222 
-
223 
->MA0024.3	E2F1
224 
-A  [ 254  241  208   54    0    0    0    2    0  524  510  493 ]
225 
-C  [ 115   46   36   71   32  599    1  588  577  171   80   59 ]
226 
-G  [  89  100  145  888  950    0 1009   17   46   20   58  112 ]
227 
-T  [ 565  638  627    1    0    2    0    0   50  119  182  219 ]
228 
-
229 
->MA0025.1	NFIL3
230 
-A  [ 1  0 22  0  2  0 23 22  0  7  5 ]
231 
-C  [ 0  0  0  8  0  0  0  0 11  5  5 ]
232 
-G  [ 0  2  0  0 21  0  0  1  4  7  3 ]
233 
-T  [22 21  1 15  0 23  0  0  8  4 10 ]
234 
-
235 
->MA0026.1	Eip74EF
236 
-A  [ 2  5  0  0 17 17  5 ]
237 
-C  [12 12  0  0  0  0  1 ]
238 
-G  [ 2  0 17 17  0  0 10 ]
239 
-T  [ 1  0  0  0  0  0  1 ]
240 
-
241 
->MA0027.1	En1
242 
-A  [4 5 3 0 4 3 3 2 1 1 1 ]
243 
-C  [1 2 0 0 0 0 0 1 3 4 6 ]
244 
-G  [2 2 7 2 3 7 0 4 3 1 1 ]
245 
-T  [3 1 0 8 3 0 7 3 3 4 2 ]
246 
-
247 
->MA0027.2	EN1
248 
-A  [ 427  104 2891 2891    0   57 2891  689 ]
249 
-C  [1174 1328   99   28    0  483    0  683 ]
250 
-G  [ 765    5   71    0    0  162   30 1216 ]
251 
-T  [ 525 1562    0    0 2891 2891  132  302 ]
252 
-
253 
->MA0028.1	ELK1
254 
-A  [ 7 10  9  5  2  0  1 27 21 13 ]
255 
-C  [ 7  6  4 19 24  0  0  0  5  0 ]
256 
-G  [10  6 10  1  1 24 27  1  0 14 ]
257 
-T  [ 4  6  5  3  1  4  0  0  2  1 ]
258 
-
259 
->MA0028.2	ELK1
260 
-A  [45807  1217   359     0     4 45807 45807  3016   916 13274 ]
261 
-C  [ 2750 45807 45807    21    41   233   333  2361  6309  6673 ]
262 
-G  [12959  1478    59 45807 45807    62    60 45807  1123 17273 ]
263 
-T  [ 5718   236    21    26   713    25  2165   294 45807  8587 ]
264 
-
265 
->MA0029.1	Mecom
266 
-A  [14 20  0 27  1 27 26  0 27  0 24 23  6 15 ]
267 
-C  [ 2  1  1  0 10  0  0  0  0  3  1  0  7  6 ]
268 
-G  [ 6  2 25  0  0  0  1 27  0  0  0  4  7  3 ]
269 
-T  [ 5  4  1  0 16  0  0  0  0 24  2  0  7  3 ]
270 
-
271 
->MA0030.1	FOXF2
272 
-A  [ 1 10 17 13  3  7  0 27 27 27  0 27 16  7 ]
273 
-C  [10  7  4  5 11  0  0  0  0  0 25  0  4  4 ]
274 
-G  [ 7  5  2  5  8 20  0  0  0  0  0  0  2  6 ]
275 
-T  [ 9  5  4  5  0  0 27  0  0  0  2  0  5 10 ]
276 
-
277 
->MA0031.1	FOXD1
278 
-A  [ 1  0 19 20 18  1 20  7 ]
279 
-C  [ 1  0  1  0  1 18  0  2 ]
280 
-G  [17  0  0  0  1  0  0  3 ]
281 
-T  [ 1 20  0  0  0  1  0  8 ]
282 
-
283 
->MA0032.1	FOXC1
284 
-A  [ 4  2  4  6  7  0  0 16 ]
285 
-C  [ 4  5  4  4  3  0  0  0 ]
286 
-G  [ 5  6  3  5  2 16  0  0 ]
287 
-T  [ 3  3  5  1  4  0 16  0 ]
288 
-
289 
->MA0032.2	FOXC1
290 
-A  [ 6452 14324  7893  4858  2496 13117 18489 18489   122 18489  6702 ]
291 
-C  [  772   728  2008   336  1652  5372   108    56  8782    27  1558 ]
292 
-G  [  304  4165  2422 13631   390    21     0   141   165   433  1107 ]
293 
-T  [12038  1386 10596    51 18489    45    57   112  9708   184 11787 ]
294 
-
295 
->MA0033.1	FOXL1
296 
-A  [ 7 10  6 13  4 21  0 22 ]
297 
-C  [ 1  4  3  4 10  0  2  1 ]
298 
-G  [ 4  2  6  4  2  2  0  0 ]
299 
-T  [11  7  8  2  7  0 21  0 ]
300 
-
301 
->MA0033.2	FOXL1
302 
-A  [2102   10 4780 4780 4780    0 4780 ]
303 
-C  [  13  416  628   38   82 3723   54 ]
304 
-G  [2678    0   57    0   50    0    0 ]
305 
-T  [ 140 4780    0   15    0 1057   17 ]
306 
-
307 
->MA0034.1	Gam1
308 
-A  [ 4 10  3 23 25  1  3  6 10  5 ]
309 
-C  [ 6  5 13  1  0 24 14  0 11 19 ]
310 
-G  [11  7  0  1  0  0  6 19  0  1 ]
311 
-T  [ 4  3  9  0  0  0  2  0  4  0 ]
312 
-
313 
->MA0035.1	Gata1
314 
-A  [13  0 50  1 13  6 ]
315 
-C  [14  0  2  0  6 16 ]
316 
-G  [15 53  0  1 25 22 ]
317 
-T  [11  0  1 51  9  9 ]
318 
-
319 
->MA0035.2	Gata1
320 
-A  [1423  708 2782    0 4000   27 3887 3550  799 1432 1487 ]
321 
-C  [ 560 1633   31    0    0   29    0    4  681  897  829 ]
322 
-G  [1242 1235   10 4000    0  109    6  383 2296 1360 1099 ]
323 
-T  [ 775  424 1177    0    0 3835  107   63  224  311  585 ]
324 
-
325 
->MA0035.3	Gata1
326 
-A  [ 2035   506     0     0     0 17955     0     0  2166  2502  1886 ]
327 
-C  [ 4321  6406 14869   697     0     0     0 17955     0  6166  5072 ]
328 
-G  [ 2530  2792   437     0     0     0     0     0     0  6687  1598 ]
329 
-T  [ 9069  8251  2649 17258 17955     0 17955     0 15789  2600  9399 ]
330 
-
331 
->MA0036.1	GATA2
332 
-A  [13  0 52  0 25 ]
333 
-C  [13  5  0  0  7 ]
334 
-G  [18 48  1  0 15 ]
335 
-T  [ 9  0  0 53  6 ]
336 
-
337 
->MA0036.2	GATA2
338 
-A  [1569 1125 1555 1051   32    9    0   51 4380    0    0 1225  104 1256 ]
339 
-C  [ 567  768  729  525 1057 3015  192    0    0    0 4380    0 1765 1185 ]
340 
-G  [ 754 1709 1220  427  765  914    0    0    0    0    0    0 1967  224 ]
341 
-T  [1490  778  876 2377 2526  442 4188 4329    0 4380    0 3155  544 1715 ]
342 
-
343 
->MA0037.1	GATA3
344 
-A  [25  0 61  0 39 15 ]
345 
-C  [14  1  0  0  1  3 ]
346 
-G  [ 4 62  1  5  4 37 ]
347 
-T  [20  0  1 58 19  8 ]
348 
-
349 
->MA0037.2	GATA3
350 
-A  [4628    0 4628    0 4628 4628 1290 2796 ]
351 
-C  [   0    0    0    0    0    0    0  712 ]
352 
-G  [   0 4628    0    0    0    0 3338 1120 ]
353 
-T  [   0    0    0 4628    0    0    0    0 ]
354 
-
355 
->MA0038.1	Gfi1
356 
-A  [ 9 28 53 53  1  1 31  8 19  7 ]
357 
-C  [20 16  0  0  0 52  7 28 11 13 ]
358 
-G  [ 9  7  0  0  1  0  2 11  2 28 ]
359 
-T  [15  2  0  0 51  0 13  6 21  5 ]
360 
-
361 
->MA0039.1	Klf4
362 
-A  [18 33 30 23 13 20 36 32 13  2 ]
363 
-C  [ 9  0  3  1  6  4  4  2  1  1 ]
364 
-G  [ 2 13 15 19 29 23  5 13 33 46 ]
365 
-T  [20  3  1  6  1  2  4  2  2  0 ]
366 
-
367 
->MA0039.2	Klf4
368 
-A  [1468   88   14   14  277   22   42  264  123  254 ]
369 
-C  [  81    9   13   36 1922   15   80   46  130 2858 ]
370 
-G  [1022 4237 4304 4281   11 4273 2179 3902 3789  280 ]
371 
-T  [1765    6   13   16 2139   34 2042  125  289  932 ]
372 
-
373 
->MA0040.1	Foxq1
374 
-A  [ 4 13  5  3  0  0  0  0 17  0  6 ]
375 
-C  [ 4  1  2  0  0  0  0  0  0  1  0 ]
376 
-G  [ 3  3  0  0 18  0  0  0  1  4  3 ]
377 
-T  [ 7  1 11 15  0 18 18 18  0 13  9 ]
378 
-
379 
->MA0041.1	Foxd3
380 
-A  [11 30 24  1 12  0  1  5 14  6  1  0 ]
381 
-C  [ 3  2  1  4  0  0  0  0  0  7  2 12 ]
382 
-G  [26  0  0  0 34  0  0 10 21  0  4  0 ]
383 
-T  [ 7 15 22 42  1 47 46 32 12 34 40 35 ]
384 
-
385 
->MA0042.1	FOXI1
386 
-A  [ 6  4 11  0 13  0  0  0 15  0  8  2 ]
387 
-C  [ 1  8  4  0  0  0  0  0  0  0  1  1 ]
388 
-G  [14 12  8  0 18  0  0  0 16  7  4  4 ]
389 
-T  [10  7  8 31  0 31 31 31  0 24 18 24 ]
390 
-
391 
->MA0042.2	FOXI1
392 
-A  [ 618   74 5175 5175 5175  157 5175 ]
393 
-C  [  39   60  540   23   23 5175   12 ]
394 
-G  [5175   35   37    0   29   48   25 ]
395 
-T  [   0 5175    0    0   66  810    0 ]
396 
-
397 
->MA0043.1	HLF
398 
-A  [ 1  6  1  0 13  0  6  0 13 15  2  5 ]
399 
-C  [ 4  0  0  0  1 15  0  9  4  0  3  5 ]
400 
-G  [ 8 12  0  3  2  1 12  0  1  1  1  3 ]
401 
-T  [ 5  0 17 15  2  2  0  9  0  2 12  5 ]
402 
-
403 
->MA0043.2	HLF
404 
-A  [ 429 1149    7    6 2138   15 1758   53 2138 2138  127  644 ]
405 
-C  [ 735  712    1   38    0 2138   95  680  282    0 1239  737 ]
406 
-G  [ 379  989    0  248  310   35 2138    8    4    5  280  360 ]
407 
-T  [ 595  118 2138 2138   21  790   11 2138    6    7  899  397 ]
408 
-
409 
->MA0044.1	HMG-1
410 
-A  [ 0  0  0  0  0  6  3  0  0 ]
411 
-C  [ 5  0  4  2  1  1  5  1  8 ]
412 
-G  [ 8  3  0 10  0  3  0  2  1 ]
413 
-T  [ 0 10  9  1 12  3  5 10  4 ]
414 
-
415 
->MA0045.1	HMG-I/Y
416 
-A  [ 3  7  9  3 11 11 11  3  4  3  8  8  9  9 11  2 ]
417 
-C  [ 5  0  1  6  0  0  0  3  1  4  5  1  0  5  0  7 ]
418 
-G  [ 4  3  1  4  3  2  2  2  8  6  1  4  2  0  3  0 ]
419 
-T  [ 2  4  3  1  0  1  1  6  1  1  0  1  3  0  0  5 ]
420 
-
421 
->MA0046.1	HNF1A
422 
-A  [ 5  1  1  1 20 16  1  8 14  2  0 13  8  5 ]
423 
-C  [ 0  0  0  0  0  2  0  2  0  0  4  1  8 13 ]
424 
-G  [14 20  0  0  0  1  0  4  1  0  0  3  3  0 ]
425 
-T  [ 2  0 20 20  1  2 20  7  6 19 17  4  2  3 ]
426 
-
427 
->MA0046.2	HNF1A
428 
-A  [ 5209  6981   376  2914 14149 14149  1274  3340 14149   711    42 14149 14149  1488  3972 ]
429 
-C  [ 2441   415  1060  2170     3   633   423  3750     9    13   228   237   695 14149  3427 ]
430 
-G  [ 3490  7168   903   544   246     8     7  4540   339   845     4  1337  1095   655  2275 ]
431 
-T  [ 3009   636 14149 14149    14   364 14149  2518   651 14149 14149  1638   174   914  4475 ]
432 
-
433 
->MA0047.1	Foxa2
434 
-A  [ 6 11  8  0 11  0  0  0  9  0  1  0 ]
435 
-C  [ 7  3  3  1  0  1  1  0  0  9  1  5 ]
436 
-G  [ 3  1  1  0  6  0  0  6  8  0  1  0 ]
437 
-T  [ 1  2  5 16  0 16 16 11  0  8 14 12 ]
438 
-
439 
->MA0047.2	Foxa2
440 
-A  [  1 221   1   1   1 736   2 338  50 417 131 129 ]
441 
-C  [  1   3   1   3   1   4 725  77 265   6  53 195 ]
442 
-G  [  1 582   1  36 175  67   2   3  58  24 482 290 ]
443 
-T  [805   3 806 769 634   3  81 391 436 360 140 189 ]
444 
-
445 
->MA0048.1	NHLH1
446 
-A  [13 13  3  1 54  1  1  1  0  3  2  5 ]
447 
-C  [13 39  5 53  0  1 50  1  0 37  0 17 ]
448 
-G  [17  2 37  0  0 52  3  0 53  8 37 12 ]
449 
-T  [11  0  9  0  0  0  0 52  1  6 15 20 ]
450 
-
451 
->MA0048.2	NHLH1
452 
-A  [ 788  461    3 2166    0   96    0    2  296  308 ]
453 
-C  [2166  179 2166    3  301 2166    4    4 2166  736 ]
454 
-G  [ 181 2166    0    1 2166  124    4 2166  102 2166 ]
455 
-T  [ 111  142    0    0  114    0 2166    1  350 1489 ]
456 
-
457 
->MA0049.1	hb
458 
-A  [ 1  6  9  4 13 16 16 14 15  9 ]
459 
-C  [ 5  8  3  3  1  0  0  0  1  2 ]
460 
-G  [ 8  2  4  1  0  0  0  2  0  2 ]
461 
-T  [ 2  0  0  8  2  0  0  0  0  3 ]
462 
-
463 
->MA0050.1	IRF1
464 
-A  [ 6 19 19 20  5  0  1 20 19 20  1  1 ]
465 
-C  [ 4  0  0  0  3 10  1  0  1  0 13 13 ]
466 
-G  [10  1  0  0 11  0 18  0  0  0  6  1 ]
467 
-T  [ 0  0  1  0  1 10  0  0  0  0  0  5 ]
468 
-
469 
->MA0050.2	IRF1
470 
-A  [ 316  251  173  138  735   24   12    0    0    0  913   20   16    7   11   17  513  218  145  198  166 ]
471 
-C  [ 320  284  324  430  101  792    0   31   56 1249   39  787    1   14   58 1023  245  464  186  193  331 ]
472 
-G  [ 266  251  212  148  361  506    0    0    4    0  238  345    0    5    0   28  263  291  114   99  151 ]
473 
-T  [ 460  576  653  646  165   40 1350 1331 1302  113  172  210 1345 1336 1293  294  341  389  917  872  714 ]
474 
-
475 
->MA0051.1	IRF2
476 
-A  [ 0  2 12 11 12  2  0  0 12 12 12  0  0  5  6  6  5  3 ]
477 
-C  [ 4  0  0  0  0  0  6  0  0  0  0  6  7  2  0  1  2  6 ]
478 
-G  [ 7 10  0  0  0 10  0 12  0  0  0  6  2  3  2  1  1  1 ]
479 
-T  [ 1  0  0  1  0  0  6  0  0  0  0  0  3  2  4  4  4  2 ]
480 
-
481 
->MA0052.1	MEF2A
482 
-A  [ 1  0 57  2  9  6 37  2 56  6 ]
483 
-C  [50  0  1  1  0  0  0  0  0  0 ]
484 
-G  [ 0  0  0  0  0  0  0  0  2 50 ]
485 
-T  [ 7 58  0 55 49 52 21 56  0  2 ]
486 
-
487 
->MA0052.2	MEF2A
488 
-A  [ 481  169  116    0 1272 1008 1383 1352 1390    6 1472  231  587  530  345 ]
489 
-C  [ 148  149 1179  473   68    0    0    5    0    0    0   49  632  409  449 ]
490 
-G  [ 379  625   32    0   14  119   39    0    0    0    0 1160  112  110  203 ]
491 
-T  [ 465  530  146 1000  119  346   51  116   83 1467    1   33  142  424  476 ]
492 
-
493 
->MA0052.3	MEF2A
494 
-A  [166  51   0 971 517 971 971 971   0 971 165 603 ]
495 
-C  [ 86 971   9   3   0   2   0   4   2   2   5 368 ]
496 
-G  [475   3   0   0   2   0   0   0   0   0 971  41 ]
497 
-T  [496  51 971   4 454 155  51  39 971   1  12  95 ]
498 
-
499 
->MA0053.1	MNB1A
500 
-A  [15 15 15  0  3 ]
501 
-C  [ 0  0  0  0  9 ]
502 
-G  [ 0  0  0 15  0 ]
503 
-T  [ 0  0  0  0  3 ]
504 
-
505 
->MA0054.1	myb.Ph3
506 
-A  [19 64 63  4 10 10 13  3 28 ]
507 
-C  [ 3  1  0 62 27  2  8 17  1 ]
508 
-G  [ 2  2  2  3 16 53  0  1  0 ]
509 
-T  [46  3  5  1 17  5 49 49 41 ]
510 
-
511 
->MA0056.1	MZF1
512 
-A  [ 3  0  2  0  0 18 ]
513 
-C  [ 5  0  0  0  0  0 ]
514 
-G  [ 4 19 18 19 20  2 ]
515 
-T  [ 8  1  0  1  0  0 ]
516 
-
517 
->MA0057.1	MZF1(var.2)
518 
-A  [ 1  2 15  0  0  0  0  3 10  8 ]
519 
-C  [ 4  0  1  0  0  2  0  1  0  2 ]
520 
-G  [ 7  7  0 11 15 14 14  8  4  4 ]
521 
-T  [ 4  7  0  5  1  0  2  4  2  2 ]
522 
-
523 
->MA0058.1	MAX
524 
-A  [ 6 11  5  0 16  0  1  0  0  6 ]
525 
-C  [ 1  1  7 17  1 17  0  0  0  3 ]
526 
-G  [ 6  5  1  0  0  0 16  0 17  5 ]
527 
-T  [ 4  0  4  0  0  0  0 17  0  3 ]
528 
-
529 
->MA0058.2	MAX
530 
-A  [12557 13557  5014     0 24565     0 19618     0     0   122 ]
531 
-C  [  741  1112  3587 24565     0 24565     0     0     0  2889 ]
532 
-G  [ 8243  6781 12571     0     0     0  4947     0 24565 14194 ]
533 
-T  [ 3024  3115  3393     0     0     0     0 24565     0  7360 ]
534 
-
535 
->MA0058.3	MAX
536 
-A  [3307 1915   39 6876    0  329   69    0 1341 1122 ]
537 
-C  [1556 2809 6876    0 6876   39  159   27 2450 2225 ]
538 
-G  [1295 1514    0   87    7 6876   20 6876 1638  986 ]
539 
-T  [ 719  637    0   38  229   19 6876   36 1446 2543 ]
540 
-
541 
->MA0059.1	MAX::MYC
542 
-A  [ 7 15  2  1 21  0  1  0  0  1  3 ]
543 
-C  [ 1  1  9 20  0 20  0  1  0  1  5 ]
544 
-G  [ 9  4  9  0  0  0 20  0 21 18  0 ]
545 
-T  [ 4  1  1  0  0  1  0 20  0  1 13 ]
546 
-
547 
->MA0060.1	NFYA
548 
-A  [ 34  16   7  58  51   0   2 112 116   0  14  66  13  39  36  25 ]
549 
-C  [ 37  33  51  14   4 116 113   0   0   1  65   6  20  43   9  35 ]
550 
-G  [ 27  26  25  41  56   0   1   1   0   0  33  42  73  22  47  29 ]
551 
-T  [ 18  41  33   3   5   0   0   3   0 115   4   2  10  12  24  27 ]
552 
-
553 
->MA0060.2	NFYA
554 
-A  [4708 1187 3548 1203 1826  192  237   16  222 8555    5   10   29   12  377  460 1537 4261 ]
555 
-C  [1515  987 2256 2973 2344  834 7384  993 1018    2   52    5   10   70 2677 3943 4176 1136 ]
556 
-G  [ 983 4580 2168 3978  313 4788  481  242 7181  150    8    5 8720 8683   15 1873 2227 2707 ]
557 
-T  [1562 2014  796  614 4285 2954  666 7517  347   61 8703 8748    9    3 5699 2492  828  664 ]
558 
-
559 
->MA0062.1	GABPA
560 
-A  [5 1 1 0 0 7 7 0 3 0 ]
561 
-C  [1 5 6 0 0 0 0 0 1 2 ]
562 
-G  [1 1 0 7 7 0 0 7 1 4 ]
563 
-T  [0 0 0 0 0 0 0 0 2 1 ]
564 
-
565 
->MA0062.2	Gabpa
566 
-A  [ 32  70   0   0 991 989  94  56 154 264 233 ]
567 
-C  [768 914   0   0   1   2  32 261 137 262 357 ]
568 
-G  [188   4 990 991   1   0 866  37 603 415 224 ]
569 
-T  [  1   1   1   0   0   2   0 637  96  49 176 ]
570 
-
571 
->MA0063.1	Nkx2-5
572 
-A  [ 7  0 17 17  0  4  2 ]
573 
-C  [ 0  4  0  0  0  2  1 ]
574 
-G  [ 1  0  0  0  7  0 11 ]
575 
-T  [ 9 13  0  0 10 11  3 ]
576 
-
577 
->MA0064.1	PBF
578 
-A  [16 16 16  0  1 ]
579 
-C  [ 0  0  0  0  9 ]
580 
-G  [ 0  0  0 16  1 ]
581 
-T  [ 0  0  0  0  5 ]
582 
-
583 
->MA0065.1	PPARG::RXRA
584 
-A  [10  7 19 13 17  0  0  0  2 41 41 39  0  0  0  2 38 10 13  7 ]
585 
-C  [12 13  4  1  0  0  0  2 37  0  0  0  0  0  2 36  1 12 15 10 ]
586 
-G  [ 7  8  6 27 24 41 39  0  2  0  0  2 41 39  0  1  2  4  9 12 ]
587 
-T  [12 13 12  0  0  0  2 39  0  0  0  0  0  2 39  2  0 15  4 12 ]
588 
-
589 
->MA0065.2	Pparg::Rxra
590 
-A  [ 94 101 390 100 139 145  71 819 522 713  82  41  22  54 676 ]
591 
-C  [317 166  23   3  15 129 547  21  48   5   2   9  99 555  58 ]
592 
-G  [320 127 368 671 674 395 179  15 270 137 767 693 263 144  47 ]
593 
-T  [126 464  79  87  34 193  66   8  23   9  12 120 479 109  81 ]
594 
-
595 
->MA0066.1	PPARG
596 
-A  [ 3  3 19  0  1  0  2 26  5  5  4  1  2 22  1  0  3 22  5  7 ]
597 
-C  [ 8  0  0  1  0  1 23  1 15  7  2  0  5  5 27 25 12  5 12  0 ]
598 
-G  [14  0  9 27 26  4  3  0  4 10 18  2 20  0  0  0  0  0  6  1 ]
599 
-T  [ 3 25  0  0  1 23  0  1  4  6  4 25  1  1  0  3 13  1  5 20 ]
600 
-
601 
->MA0067.1	Pax2
602 
-A  [10  7  3  0 26  2  2  1 ]
603 
-C  [ 7  1  2 28  1 17  0 11 ]
604 
-G  [ 5 21  0  1  3  1 19 11 ]
605 
-T  [ 9  2 26  2  1 11 10  8 ]
606 
-
607 
->MA0068.1	Pax4
608 
-A  [ 7 20 16 11 13 11  6  9  5  5  6  7  8  6 10  4  3  7  4  9  5  5  7  6  3  7  3  1  6  3 ]
609 
-C  [ 2  0  2  1  1  3  1  1  3 11 11  7  7  5  5  8  6  8  9  6  7  6 11  9 12  9 12 11 11 13 ]
610 
-G  [11  1  1  1  3  1  2  1  6  1  4  5  2  1  4  4  4  3  3  2  5  2  0  1  2  2  2  3  1  2 ]
611 
-T  [ 1  0  2  8  4  6 12 10  7  4  0  2  4  9  2  5  8  3  5  4  4  8  3  5  4  3  4  6  3  3 ]
612 
-
613 
->MA0068.2	PAX4
614 
-A  [ 37  58 333 333   0  18 333 150 ]
615 
-C  [333  30   2   0   0  11  89  93 ]
616 
-G  [ 47 120   0   0   5  10  11 333 ]
617 
-T  [105 333   3   0 333 333  12  41 ]
618 
-
619 
->MA0069.1	Pax6
620 
-A  [ 2  2  4 39  3  1  1 21  1  2 36 11  1  1 ]
621 
-C  [ 4  2 26  2 34  0 37  2  4 14  0 11  5  0 ]
622 
-G  [ 4  0  1  1  1 41  4  2  1 25  6 13  3 17 ]
623 
-T  [33 39 12  1  5  1  1 18 37  2  1  8 34 25 ]
624 
-
625 
->MA0070.1	PBX1
626 
-A  [ 5  3 16  1  0 17 17  0  0 16 12  8 ]
627 
-C  [ 6  9  1  1 18  1  0  0 18  1  0  2 ]
628 
-G  [ 2  3  1  0  0  0  0  1  0  0  1  2 ]
629 
-T  [ 5  3  0 16  0  0  1 17  0  1  5  6 ]
630 
-
631 
->MA0071.1	RORA
632 
-A  [15  9  6 11 21  0  0  0  0 25 ]
633 
-C  [ 1  1 12  2  0  0  0  0 25  0 ]
634 
-G  [ 2  0  4  5  4 25 25  0  0  0 ]
635 
-T  [ 7 15  3  7  0  0  0 25  0  0 ]
636 
-
637 
->MA0072.1	RORA(var.2)
638 
-A  [ 9 17 15 35 23  2  0 28  0  0  0  0 36 15 ]
639 
-C  [ 8  2  0  1  0 12  0  0  0  0  0 36  0  6 ]
640 
-G  [ 8  7  3  0  0 13  0  8 36 36  0  0  0 10 ]
641 
-T  [11 10 18  0 13  9 36  0  0  0 36  0  0  5 ]
642 
-
643 
->MA0073.1	RREB1
644 
-A  [ 3  1  3  0  7  9  8  4  0 11  4  1  3  4  2  4  4  4  1  4 ]
645 
-C  [ 8 10  8 11  4  2  3  6 11  0  7 10  8  6  9  5  5  6  7  4 ]
646 
-G  [ 0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  1  0  0  1  0  3  2 ]
647 
-T  [ 0  0  0  0  0  0  0  1  0  0  0  0  0  0  0  2  1  1  0  1 ]
648 
-
649 
->MA0074.1	RXRA::VDR
650 
-A  [ 3  0  0  0  0  9  4  2  2  5  0  0  1  0  7 ]
651 
-C  [ 0  0  0  0  9  0  2  4  0  0  0  0  0  9  1 ]
652 
-G  [ 7 10  9  0  0  1  0  2  8  5 10  0  0  0  2 ]
653 
-T  [ 0  0  1 10  1  0  4  2  0  0  0 10  9  1  0 ]
654 
-
655 
->MA0075.1	Prrx2
656 
-A  [52 59  0  0 58 ]
657 
-C  [ 2  0  0  0  0 ]
658 
-G  [ 4  0  1  0  1 ]
659 
-T  [ 1  0 58 59  0 ]
660 
-
661 
->MA0075.2	Prrx2
662 
-A  [ 644  407 3849 3849   13  466 3849 1234 ]
663 
-C  [1522 2052  361  232   22  504  198  878 ]
664 
-G  [ 715  250  412  124   11  239   39 1035 ]
665 
-T  [ 969 1797  298   70 3849 3849  400  702 ]
666 
-
667 
->MA0076.1	ELK4
668 
-A  [16  0  0  0  0 20 16  4  1 ]
669 
-C  [ 1 20 20  0  0  0  0  1  6 ]
670 
-G  [ 2  0  0 20 20  0  0 15  0 ]
671 
-T  [ 1  0  0  0  0  0  4  0 13 ]
672 
-
673 
->MA0076.2	ELK4
674 
-A  [ 298  391 2034    0    8    0    0    0    0    0  290 ]
675 
-C  [1458 1905  145 2688    0    0 3427 3427    0  501 1253 ]
676 
-G  [ 886  570 1038   16    0    0    0    0 2915 2843  668 ]
677 
-T  [ 785  561  210  723 3419 3427    0    0  512   83 1216 ]
678 
-
679 
->MA0077.1	SOX9
680 
-A  [ 3  8 71  2  7  2 13  9 14 ]
681 
-C  [55 38  1  1  0  2  0  7 31 ]
682 
-G  [ 9  6  0  2  4 72  4  6  7 ]
683 
-T  [ 9 24  4 71 65  0 59 54 24 ]
684 
-
685 
->MA0078.1	Sox17
686 
-A  [ 7  8  3 30  0  0  0  0  0 ]
687 
-C  [ 9  8 18  0  1  0  0  0 17 ]
688 
-G  [ 6  4  1  0  0  0 31  2 10 ]
689 
-T  [ 9 11  9  1 30 31  0 29  4 ]
690 
-
691 
->MA0079.1	SP1
692 
-A  [1 2 0 0 0 2 0 0 1 2 ]
693 
-C  [1 1 0 0 5 0 1 0 1 0 ]
694 
-G  [4 4 8 8 2 4 5 6 6 0 ]
695 
-T  [2 1 0 0 1 2 2 2 0 6 ]
696 
-
697 
->MA0079.2	SP1
698 
-A  [ 0  0  0  4  2  0  1  0  6  3 ]
699 
-C  [32 30 35 27  5 28 31 24 25 26 ]
700 
-G  [ 1  1  0  0 15  1  0  3  0  3 ]
701 
-T  [ 2  4  0  4 13  6  3  8  4  3 ]
702 
-
703 
->MA0079.3	SP1
704 
-A  [ 857    0   99    0    0 1359    0    0    0 1054  652 ]
705 
-C  [1786 6215 6703 8734 8661    0 8734 8734 6679 6357 4969 ]
706 
-G  [4271  642    0    0    0 4624    0    0    0    0  734 ]
707 
-T  [1820 1877 1932    0   73 2751    0    0 2055 1323 2379 ]
708 
-
709 
->MA0080.1	SPI1
710 
-A  [14  4  3 56 56  3 ]
711 
-C  [21  2  0  1  0 18 ]
712 
-G  [19 48 52  0  0 34 ]
713 
-T  [ 3  3  2  0  1  2 ]
714 
-
715 
->MA0080.2	SPI1
716 
-A  [33  4  4 42 41  5  3 ]
717 
-C  [ 3  0  0  0  0  3  5 ]
718 
-G  [ 6 37 38  0  1 33  2 ]
719 
-T  [ 0  1  0  0  0  1 32 ]
720 
-
721 
->MA0080.3	Spi1
722 
-A  [24957 27071 38966 42251 38682 12577 45356  4801     0 63665 63715  3436  8250  3893 21911 ]
723 
-C  [10470  7875  3311  3103   534  8120  3209     0     0     0     0 10145  3223 12038 12028 ]
724 
-G  [17557 22021 13786 12032 11483 43018 14683 58914 63715    50     0 50134  3385 45501 21003 ]
725 
-T  [10731  6748  7652  6329 13016     0   467     0     0     0     0     0 48857  2283  8773 ]
726 
-
727 
->MA0080.4	SPI1
728 
-A  [3946 4976 5053 5044 4868   49 1793   29    0 5105 5122    0   21 2535 ]
729 
-C  [ 555   26    2    0    4  246 4068    1    1    2    1  184   69  288 ]
730 
-G  [1142  377    8    0   15 5255  727 5300 5330    0    1 5246   12  733 ]
731 
-T  [ 476   82   30   99  524    2    1    2    0    1    5    1 4962 1439 ]
732 
-
733 
->MA0081.1	SPIB
734 
-A  [31  4 24  2  1 48 47 ]
735 
-C  [ 0 14 16  0  0  0  0 ]
736 
-G  [ 0 29  7 47 47  0  0 ]
737 
-T  [18  2  2  0  1  1  2 ]
738 
-
739 
->MA0082.1	squamosa
740 
-A  [11  0 24 16 23 17 24  8 14  1 14 25 21  7 ]
741 
-C  [14 22  0  2  0  0  1  0  1  1  5  5  2  5 ]
742 
-G  [ 1  0  4  1  0  0  0  1 15 28  1  0  3  8 ]
743 
-T  [ 4  8  2 11  7 13  5 21  0  0 10  0  4 10 ]
744 
-
745 
->MA0083.1	SRF
746 
-A  [ 2  9  0  1 32  3 46  1 43 15  2  2 ]
747 
-C  [ 1 33 45 45  1  1  0  0  0  1  0  1 ]
748 
-G  [39  2  1  0  0  0  0  0  0  0 44 43 ]
749 
-T  [ 4  2  0  0 13 42  0 45  3 30  0  0 ]
750 
-
751 
->MA0083.2	SRF
752 
-A  [ 426 1017  515  270  477   49    0 1767 1184 2226  590 2048 1452   68   15  608 1353 1299 ]
753 
-C  [ 813  446  285  257  681 2144 2105   66    0    0  120   12   10    0    7  864  504  178 ]
754 
-G  [ 281  331  206 1000  533    0    0   23   73   16   16   51   87 2209 2255  441  230  460 ]
755 
-T  [ 757  483 1271  750  586   84  172  421 1020   35 1551  166  728    0    0  364  190  340 ]
756 
-
757 
->MA0083.3	SRF
758 
-A  [ 214   75  627    0    3 1137   54 1163    1 1162  439    8    8  262  337  913 ]
759 
-C  [ 125  152  611 1771 1787   13    0    0    5    0   12    9    2  105 1023   63 ]
760 
-G  [  80 1144  144   15   11   18    6    2    8    0    0 1896 1872  670  145   98 ]
761 
-T  [1129  372  167    0   19   61 1571    0 1610   16 1074    0    7  686   72  248 ]
762 
-
763 
->MA0084.1	SRY
764 
-A  [ 5  8 15 18 25  0 28 27  7 ]
765 
-C  [ 5  3  0  3  0 26  0  0  0 ]
766 
-G  [10  4  3  3  0  0  0  1  2 ]
767 
-T  [ 8 13 10  4  3  2  0  0 19 ]
768 
-
769 
->MA0085.1	Su(H)
770 
-A  [ 1  0  0  0  0  3  0 10 10  5  1  1  4  3  4  2 ]
771 
-C  [ 3  4  0  0  0  0  0  0  0  5  7  2  2  1  3  1 ]
772 
-G  [ 3  0 10  0 10  7 10  0  0  0  1  4  2  4  2  2 ]
773 
-T  [ 3  6  0 10  0  0  0  0  0  0  1  3  2  2  1  5 ]
774 
-
775 
->MA0086.1	sna
776 
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-
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-
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-
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-
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-
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-T  [ 314   51   18   32 1132  867   24  291  511  367 ]
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-
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-
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-
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897