Browse code

Changed jaspar2016 to redundant matrices

Matthew Richards authored on 22/05/2017 23:03:31
Showing4 changed files

1 1
Binary files a/inst/extdata/jaspar2016.RData and b/inst/extdata/jaspar2016.RData differ
2 2
new file mode 100644
... ...
@@ -0,0 +1,99 @@
1
+source("./import.R")
2
+run("..")
3
+ls()
4
+matrix.id
5
+id.pieces
6
+n
7
+n
8
+n
9
+n
10
+new.row
11
+n
12
+n
13
+n
14
+full.name
15
+c
16
+c
17
+c
18
+matrix.id
19
+c
20
+c
21
+c
22
+Q
23
+source("./import.R")
24
+source("./import.R")
25
+run("..")
26
+library(MotifDb)
27
+length(MotifDb)
28
+humans <- query(query(MotifDb, 'hsapiens'),'jaspar2016')
29
+head(humans)
30
+tbl <- read.table("./md-raw.tsv", sep = "\t", header = TRUE)
31
+head(tbl)
32
+ncbiTaxonimicCodeToBiocLinnaean(9606)
33
+ncbiTaxonimicCodeToBiocLinnaean(3702)
34
+jaspar <- query(MotifDb, 'jaspar2016')
35
+head(jaspar)
36
+head(jaspar, 40)
37
+head(tbl$ncbi.tax.code)
38
+which(tbl$matrix.id == 'MA0002.1')
39
+names(tbl)
40
+which(tbl$id == 'MA0002')
41
+which(tbl$ma.name == 'MA0002')
42
+which(tbl$ma.name == 'MA0002' & tbl$unknown == '1')
43
+which(tbl$ma.name == 'MA0002' & tbl$unknown == '2')
44
+which(tbl$ma.name == 'MA0003')
45
+run("..")
46
+blah <- load("./jaspar2016.RData")
47
+load("./jaspar2016.RData")
48
+head(tbl.md)
49
+source("./import.R")
50
+run("..")
51
+c
52
+tbl.md
53
+md
54
+id.pieces
55
+\Q
56
+Q
57
+run("..")
58
+id.pieces
59
+matrix.id
60
+head(matrix.ids)
61
+length(matrices)
62
+head(name(matrices))
63
+head(names(matrices))
64
+head(matrices)
65
+Q
66
+ls()
67
+head(tbl)
68
+which(tbl$ma.name == "MA0001")
69
+subset(tbl$ma.name == "MA0001")
70
+subset(tbl,ma.name == "MA0001")
71
+subset(tbl,ma.name == "MA0003")
72
+subset(tbl,ma.name == "MA0002")
73
+run("..")
74
+Q
75
+source("./import.R")
76
+run("..")
77
+traceback()
78
+nchar(NA)
79
+is.na(NA)
80
+md <- as.list(subset(tbl, ma.name == "MA0121" & unknown == "1"))
81
+md
82
+md <- as.list(subset(tbl, ma.name == "MA0102" & unknown == "1"))
83
+md
84
+ls()
85
+guessProteinIdentifierType(NA)
86
+source("./import.R")
87
+guessProteinIdentifierType(NA)
88
+moleculeName <- NA
89
+guessProteinIdentifierType(moleculeName)
90
+is.na(moleculeName)
91
+source("./import.R")
92
+is.na(moleculeName)
93
+guessProteinIdentifierType(NA)
94
+run("..")
95
+detach("package:MotifDb", unload = TRUE)
96
+library(MotifDb)
97
+length(MotifDb)
98
+q()
99
+n
... ...
@@ -96,7 +96,7 @@ createMetadataTable = function (dataDir, matrices, raw.metadata.filename)
96 96
     md <- as.list(subset(tbl.raw,
97 97
                          ma.name==id.pieces[[1]][1] & unknown == id.pieces[[1]][2]))
98 98
     print(matrix.id)
99
-    # browser()
99
+    #browser()
100 100
     stopifnot(length(md$id) == 1)
101 101
     dataSource <- "jaspar2016"
102 102
     organism <- ncbiTaxonimicCodeToBiocLinnaean(md$ncbi.tax.code)
... ...
@@ -116,7 +116,11 @@ createMetadataTable = function (dataDir, matrices, raw.metadata.filename)
116 116
                     experimentType=md$type,
117 117
                     pubmedID="24194598")
118 118
     tbl.md = rbind (tbl.md, data.frame (new.row, stringsAsFactors=FALSE))
119
-    full.name = sprintf ('%s-%s-%s-%s', organism, dataSource, md$gene.symbol, short.matrix.name)
119
+    full.name = sprintf ('%s-%s-%s-%s',
120
+                         organism,
121
+                         dataSource,
122
+                         md$gene.symbol,
123
+                         matrix.id)
120 124
     rownames (tbl.md) [nrow (tbl.md)] = full.name
121 125
     } # for i
122 126
 
... ...
@@ -135,10 +139,11 @@ renameMatrices = function (matrices, tbl.md)
135 139
 # an empirical and not altogether trustworthy solution to identifying identifier types.
136 140
 guessProteinIdentifierType = function (moleculeName)
137 141
 {
142
+      if (is.na (moleculeName))
143
+          return (NA_character_)      
138 144
   if (nchar (moleculeName) == 0)
139 145
     return (NA_character_)
140
-  if (is.na (moleculeName))
141
-    return (NA_character_) 
146
+
142 147
 
143 148
   first.char = substr (moleculeName, 1, 1)
144 149
 
... ...
@@ -1,15 +1,39 @@
1
+>MA0001.1	AGL3
2
+A  [ 0  3 79 40 66 48 65 11 65  0 ]
3
+C  [94 75  4  3  1  2  5  2  3  3 ]
4
+G  [ 1  0  3  4  1  0  5  3 28 88 ]
5
+T  [ 2 19 11 50 29 47 22 81  1  6 ]
6
+
1 7
 >MA0001.2	AGL3
2 8
 A  [22 16 25 27  0  0 82 40 56 35 65 25 64  0 33 52 45 21 ]
3 9
 C  [29  9  8 16 92 79  1  4  0  0  1  4  0  0 14  5 23 24 ]
4 10
 G  [34 29  4 13  0  0  2  3  1  0  4  3 28 92 15  7 13 26 ]
5 11
 T  [10 41 58 39  3 16 10 48 38 60 25 63  3  3 33 31 14 24 ]
6 12
 
13
+>MA0002.1	RUNX1
14
+A  [10 12  4  1  2  2  0  0  0  8 13 ]
15
+C  [ 2  2  7  1  0  8  0  0  1  2  2 ]
16
+G  [ 3  1  1  0 23  0 26 26  0  0  4 ]
17
+T  [11 11 14 24  1 16  0  0 25 16  7 ]
18
+
7 19
 >MA0002.2	RUNX1
8 20
 A  [ 287  234  123   57    0   87    0   17   10  131  500 ]
9 21
 C  [ 496  485 1072    0   75  127    0   42  400  463  158 ]
10 22
 G  [ 696  467  149    7 1872   70 1987 1848  251   81  289 ]
11 23
 T  [ 521  814  656 1936   53 1716   13   93 1339 1325 1053 ]
12 24
 
25
+>MA0003.1	TFAP2A
26
+A  [  0   0   0  22  19  55  53  19   9 ]
27
+C  [  0 185 185  71  57  44  30  16  78 ]
28
+G  [185   0   0  46  61  67  91 137  79 ]
29
+T  [  0   0   0  46  48  19  11  13  19 ]
30
+
31
+>MA0003.2	TFAP2A
32
+A  [1387 2141  727 1517   56    0    0   62  346 3738  460    0  116  451 3146 ]
33
+C  [1630 1060 1506  519 1199 5098 4762 1736 2729  236    0    0 1443 3672  690 ]
34
+G  [ 851  792  884  985 3712    0    0   85 1715  920 4638 5098 3455  465  168 ]
35
+T  [1230 1105 1981 2077  131    0  336 3215  308  204    0    0   84  510 1094 ]
36
+
13 37
 >MA0003.3	TFAP2A
14 38
 A  [1706  137    0    0   33  575 3640 1012    0   31 1865 ]
15 39
 C  [1939  968 5309 5309 1646 2682  995  224   31 4726  798 ]
... ...
@@ -22,6 +46,12 @@ C  [16  0 20  0  0  0 ]
22 46
 G  [ 0  1  0 20  0 20 ]
23 47
 T  [ 0  0  0  0 20  0 ]
24 48
 
49
+>MA0005.1	AG
50
+A  [ 0  2 38 61 73 31 23 20 22  1 27 ]
51
+C  [87 86  9  5  1  3 16 13  0  0 25 ]
52
+G  [ 2  0  7  2  1  4 17 26 64 82  9 ]
53
+T  [ 1  2 36 22 15 52 34 31  4  7 29 ]
54
+
25 55
 >MA0005.2	AG
26 56
 A  [21  9 10 29  0  0 31 47 52 25 17 19  7  2 22 45 40 15 ]
27 57
 C  [20  3  0  8 66 65  3  2  0  0 15  8  0  0 17  4  6 10 ]
... ...
@@ -34,18 +64,42 @@ C  [ 8  0 23  0  0  0 ]
34 64
 G  [ 2 23  0 23  0 24 ]
35 65
 T  [11  1  1  1 24  0 ]
36 66
 
67
+>MA0007.1	Ar
68
+A  [ 9  9 11 16  0 12 21  0 15  4  5  6  3  0  4 11  1  3  6  6 10  5 ]
69
+C  [ 7  2  3  1  0  6  2 24  0  9 11  9  5  0  0  5 22 16  7  5 11 11 ]
70
+G  [ 2  3  3  7 22  1  0  0  8  2  2  9  1 24  0  1  1  1  5  9  0  6 ]
71
+T  [ 6 10  7  0  2  5  1  0  1  9  6  0 15  0 20  7  0  4  6  4  3  2 ]
72
+
73
+>MA0007.2	AR
74
+A  [ 6277  6497     0  6462 11206    26 10426  1478  4353  3312  3241     0  2214  2656  1599 ]
75
+C  [ 1112     0     0  1304     0 11115     0  2976  2096  3249   142   525  1262  2434  7032 ]
76
+G  [ 3049  4709 11206  1254     0    65   107  4023  2151  3291   305 10681   671  2460   298 ]
77
+T  [  768     0     0  2186     0     0   673  2729  2606  1354  7518     0  7059  3656  2277 ]
78
+
37 79
 >MA0007.3	Ar
38 80
 A  [1094  939    8 1197 2167    4 1997  199  561  755   33    0   22 1195    7   32  430 ]
39 81
 C  [ 167   17    0  291    5 2189   20 1228  611  250  277    4    4  112 2166 1542 1092 ]
40 82
 G  [1555 2221 3837  184    3    5  273  328  991 1673    8 3618    0  230    0    2  343 ]
41 83
 T  [ 286   19    6 1027    3    2   11  712  509  207 2529    1 2768 1094    8  829  913 ]
42 84
 
85
+>MA0008.1	HAT5
86
+A  [ 3 21 25  0  0 24  1  0 ]
87
+C  [13  1  0  0  5  0  0  0 ]
88
+G  [ 4  0  0  0  0  1  0  2 ]
89
+T  [ 5  3  0 25 20  0 24 23 ]
90
+
43 91
 >MA0008.2	HAT5
44 92
 A  [ 1  4  3 22 25  0  0 25  0  0  3  2 ]
45 93
 C  [ 5  5 13  1  0  0  5  0  0  0  1  8 ]
46 94
 G  [ 3  3  4  0  0  0  0  0  0  0 12  4 ]
47 95
 T  [10 10  3  1  0 25 20  0 25 25  0  1 ]
48 96
 
97
+>MA0009.1	T
98
+A  [ 2  1 40  0  0  0  0  0  1 40 31 ]
99
+C  [28  1  0  0  0  0  0  2  7  0  5 ]
100
+G  [ 8  0  0 40 40  0 40  0 28  0  0 ]
101
+T  [ 2 38  0  0  0 40  0 38  4  0  4 ]
102
+
49 103
 >MA0009.2	T
50 104
 A  [  52 2241 3816    0 4107  218 2277  629 4161 1066  665    0   12  504  373 4171 ]
51 105
 C  [ 156 4778   55 5262    0 5104 4418  611  121 2004  135  190    0 2352 1237   12 ]
... ...
@@ -76,6 +130,12 @@ C  [1 0 0 0 0 0 0 3 0 0 1 ]
76 130
 G  [0 0 4 0 1 0 1 1 1 0 0 ]
77 131
 T  [4 2 0 5 0 0 0 1 2 1 2 ]
78 132
 
133
+>MA0014.1	Pax5
134
+A  [ 4  4  4  1  2  7  2  0  1  6  6  0  2  3  1  6  5  2  2  5 ]
135
+C  [ 1  0  3  2  7  2  5  3  2  1  0  0  8  0  0  1  1 10  5  0 ]
136
+G  [ 4  8  3  5  1  1  3  2  8  3  2 12  1  9  4  5  5  0  5  6 ]
137
+T  [ 3  0  2  4  2  2  2  7  1  2  4  0  1  0  7  0  1  0  0  1 ]
138
+
79 139
 >MA0014.2	PAX5
80 140
 A  [261 315 308 245   0  39 766 152   9 174 542 537   0   3 317 153 225 587 152 ]
81 141
 C  [228  59  30 148 169 736  21 163 538 419   8  17 215 751  17  41   6  33 667 ]
... ...
@@ -94,12 +154,24 @@ C  [ 1  0  0  0  0 36  0 25  8 10 ]
94 154
 G  [37 36 38 38  0  1  3  3 22 16 ]
95 155
 T  [ 0  1  0  0 38  1  0  5  3  6 ]
96 156
 
157
+>MA0017.1	NR2F1
158
+A  [ 0  1 12  6  0  0  0  1  2  6  6  1  3  0 ]
159
+C  [ 0  0  0  7 13  3  2  0  0  4  5 10  6  3 ]
160
+G  [ 2 12  1  0  0  0  0  0 11  3  1  1  0  3 ]
161
+T  [11  0  0  0  0 10 11 12  0  0  1  1  4  7 ]
162
+
97 163
 >MA0017.2	NR2F1
98 164
 A  [ 4802  7266  6333  8496     0     0     0     0 12059  5116  3229  3276  5681 ]
99 165
 C  [11446  1692   387     0    30     0     0 12059     0  3055  2966  2470  2912 ]
100 166
 G  [ 3276  1153  4869  3791 12059 12059     0     0    91  1618  4395  3886 36863 ]
101 167
 T  [ 3980  1948   469     0     0     0 12059     0     0  2270  1469  2427  3466 ]
102 168
 
169
+>MA0018.1	CREB1
170
+A  [ 0  3  0  2  5  0  0 16  0  0  1  5 ]
171
+C  [ 7  5  3  3  1  0  0  0 16  0  5  6 ]
172
+G  [ 5  4  6 11  7  0 15  0  0 16  0  3 ]
173
+T  [ 4  4  7  0  3 16  1  0  0  0 10  2 ]
174
+
103 175
 >MA0018.2	CREB1
104 176
 A  [ 0  0 11  0  1  0  2  8 ]
105 177
 C  [ 1  1  0  9  0  3  7  0 ]
... ...
@@ -136,6 +208,18 @@ C  [1 0 0 0 1 1 0 1 9 8 ]
136 208
 G  [7 7 9 8 0 0 0 0 0 0 ]
137 209
 T  [1 2 0 1 4 6 9 8 0 0 ]
138 210
 
211
+>MA0024.1	E2F1
212
+A  [ 0  0  0  0  0  0  0  0 ]
213
+C  [ 0  0  0  4  2 10  0  9 ]
214
+G  [ 0  0  0  6  8  0 10  1 ]
215
+T  [10 10 10  0  0  0  0  0 ]
216
+
217
+>MA0024.2	E2F1
218
+A  [ 259  218  144    0    0    0    0    0 1059  508  305 ]
219
+C  [ 317    0  274    0 1059    0  337  286    0    0  269 ]
220
+G  [ 280  628  641 1059    0 1059  722  773    0  551  485 ]
221
+T  [ 203  213    0    0    0    0    0    0    0    0    0 ]
222
+
139 223
 >MA0024.3	E2F1
140 224
 A  [ 254  241  208   54    0    0    0    2    0  524  510  493 ]
141 225
 C  [ 115   46   36   71   32  599    1  588  577  171   80   59 ]
... ...
@@ -154,12 +238,24 @@ C  [12 12  0  0  0  0  1 ]
154 238
 G  [ 2  0 17 17  0  0 10 ]
155 239
 T  [ 1  0  0  0  0  0  1 ]
156 240
 
241
+>MA0027.1	En1
242
+A  [4 5 3 0 4 3 3 2 1 1 1 ]
243
+C  [1 2 0 0 0 0 0 1 3 4 6 ]
244
+G  [2 2 7 2 3 7 0 4 3 1 1 ]
245
+T  [3 1 0 8 3 0 7 3 3 4 2 ]
246
+
157 247
 >MA0027.2	EN1
158 248
 A  [ 427  104 2891 2891    0   57 2891  689 ]
159 249
 C  [1174 1328   99   28    0  483    0  683 ]
160 250
 G  [ 765    5   71    0    0  162   30 1216 ]
161 251
 T  [ 525 1562    0    0 2891 2891  132  302 ]
162 252
 
253
+>MA0028.1	ELK1
254
+A  [ 7 10  9  5  2  0  1 27 21 13 ]
255
+C  [ 7  6  4 19 24  0  0  0  5  0 ]
256
+G  [10  6 10  1  1 24 27  1  0 14 ]
257
+T  [ 4  6  5  3  1  4  0  0  2  1 ]
258
+
163 259
 >MA0028.2	ELK1
164 260
 A  [45807  1217   359     0     4 45807 45807  3016   916 13274 ]
165 261
 C  [ 2750 45807 45807    21    41   233   333  2361  6309  6673 ]
... ...
@@ -184,12 +280,24 @@ C  [ 1  0  1  0  1 18  0  2 ]
184 280
 G  [17  0  0  0  1  0  0  3 ]
185 281
 T  [ 1 20  0  0  0  1  0  8 ]
186 282
 
283
+>MA0032.1	FOXC1
284
+A  [ 4  2  4  6  7  0  0 16 ]
285
+C  [ 4  5  4  4  3  0  0  0 ]
286
+G  [ 5  6  3  5  2 16  0  0 ]
287
+T  [ 3  3  5  1  4  0 16  0 ]
288
+
187 289
 >MA0032.2	FOXC1
188 290
 A  [ 6452 14324  7893  4858  2496 13117 18489 18489   122 18489  6702 ]
189 291
 C  [  772   728  2008   336  1652  5372   108    56  8782    27  1558 ]
190 292
 G  [  304  4165  2422 13631   390    21     0   141   165   433  1107 ]
191 293
 T  [12038  1386 10596    51 18489    45    57   112  9708   184 11787 ]
192 294
 
295
+>MA0033.1	FOXL1
296
+A  [ 7 10  6 13  4 21  0 22 ]
297
+C  [ 1  4  3  4 10  0  2  1 ]
298
+G  [ 4  2  6  4  2  2  0  0 ]
299
+T  [11  7  8  2  7  0 21  0 ]
300
+
193 301
 >MA0033.2	FOXL1
194 302
 A  [2102   10 4780 4780 4780    0 4780 ]
195 303
 C  [  13  416  628   38   82 3723   54 ]
... ...
@@ -202,18 +310,42 @@ C  [ 6  5 13  1  0 24 14  0 11 19 ]
202 310
 G  [11  7  0  1  0  0  6 19  0  1 ]
203 311
 T  [ 4  3  9  0  0  0  2  0  4  0 ]
204 312
 
313
+>MA0035.1	Gata1
314
+A  [13  0 50  1 13  6 ]
315
+C  [14  0  2  0  6 16 ]
316
+G  [15 53  0  1 25 22 ]
317
+T  [11  0  1 51  9  9 ]
318
+
319
+>MA0035.2	Gata1
320
+A  [1423  708 2782    0 4000   27 3887 3550  799 1432 1487 ]
321
+C  [ 560 1633   31    0    0   29    0    4  681  897  829 ]
322
+G  [1242 1235   10 4000    0  109    6  383 2296 1360 1099 ]
323
+T  [ 775  424 1177    0    0 3835  107   63  224  311  585 ]
324
+
205 325
 >MA0035.3	Gata1
206 326
 A  [ 2035   506     0     0     0 17955     0     0  2166  2502  1886 ]
207 327
 C  [ 4321  6406 14869   697     0     0     0 17955     0  6166  5072 ]
208 328
 G  [ 2530  2792   437     0     0     0     0     0     0  6687  1598 ]
209 329
 T  [ 9069  8251  2649 17258 17955     0 17955     0 15789  2600  9399 ]
210 330
 
331
+>MA0036.1	GATA2
332
+A  [13  0 52  0 25 ]
333
+C  [13  5  0  0  7 ]
334
+G  [18 48  1  0 15 ]
335
+T  [ 9  0  0 53  6 ]
336
+
211 337
 >MA0036.2	GATA2
212 338
 A  [1569 1125 1555 1051   32    9    0   51 4380    0    0 1225  104 1256 ]
213 339
 C  [ 567  768  729  525 1057 3015  192    0    0    0 4380    0 1765 1185 ]
214 340
 G  [ 754 1709 1220  427  765  914    0    0    0    0    0    0 1967  224 ]
215 341
 T  [1490  778  876 2377 2526  442 4188 4329    0 4380    0 3155  544 1715 ]
216 342
 
343
+>MA0037.1	GATA3
344
+A  [25  0 61  0 39 15 ]
345
+C  [14  1  0  0  1  3 ]
346
+G  [ 4 62  1  5  4 37 ]
347
+T  [20  0  1 58 19  8 ]
348
+
217 349
 >MA0037.2	GATA3
218 350
 A  [4628    0 4628    0 4628 4628 1290 2796 ]
219 351
 C  [   0    0    0    0    0    0    0  712 ]
... ...
@@ -226,6 +358,12 @@ C  [20 16  0  0  0 52  7 28 11 13 ]
226 358
 G  [ 9  7  0  0  1  0  2 11  2 28 ]
227 359
 T  [15  2  0  0 51  0 13  6 21  5 ]
228 360
 
361
+>MA0039.1	Klf4
362
+A  [18 33 30 23 13 20 36 32 13  2 ]
363
+C  [ 9  0  3  1  6  4  4  2  1  1 ]
364
+G  [ 2 13 15 19 29 23  5 13 33 46 ]
365
+T  [20  3  1  6  1  2  4  2  2  0 ]
366
+
229 367
 >MA0039.2	Klf4
230 368
 A  [1468   88   14   14  277   22   42  264  123  254 ]
231 369
 C  [  81    9   13   36 1922   15   80   46  130 2858 ]
... ...
@@ -244,12 +382,24 @@ C  [ 3  2  1  4  0  0  0  0  0  7  2 12 ]
244 382
 G  [26  0  0  0 34  0  0 10 21  0  4  0 ]
245 383
 T  [ 7 15 22 42  1 47 46 32 12 34 40 35 ]
246 384
 
385
+>MA0042.1	FOXI1
386
+A  [ 6  4 11  0 13  0  0  0 15  0  8  2 ]
387
+C  [ 1  8  4  0  0  0  0  0  0  0  1  1 ]
388
+G  [14 12  8  0 18  0  0  0 16  7  4  4 ]
389
+T  [10  7  8 31  0 31 31 31  0 24 18 24 ]
390
+
247 391
 >MA0042.2	FOXI1
248 392
 A  [ 618   74 5175 5175 5175  157 5175 ]
249 393
 C  [  39   60  540   23   23 5175   12 ]
250 394
 G  [5175   35   37    0   29   48   25 ]
251 395
 T  [   0 5175    0    0   66  810    0 ]
252 396
 
397
+>MA0043.1	HLF
398
+A  [ 1  6  1  0 13  0  6  0 13 15  2  5 ]
399
+C  [ 4  0  0  0  1 15  0  9  4  0  3  5 ]
400
+G  [ 8 12  0  3  2  1 12  0  1  1  1  3 ]
401
+T  [ 5  0 17 15  2  2  0  9  0  2 12  5 ]
402
+
253 403
 >MA0043.2	HLF
254 404
 A  [ 429 1149    7    6 2138   15 1758   53 2138 2138  127  644 ]
255 405
 C  [ 735  712    1   38    0 2138   95  680  282    0 1239  737 ]
... ...
@@ -268,18 +418,36 @@ C  [ 5  0  1  6  0  0  0  3  1  4  5  1  0  5  0  7 ]
268 418
 G  [ 4  3  1  4  3  2  2  2  8  6  1  4  2  0  3  0 ]
269 419
 T  [ 2  4  3  1  0  1  1  6  1  1  0  1  3  0  0  5 ]
270 420
 
421
+>MA0046.1	HNF1A
422
+A  [ 5  1  1  1 20 16  1  8 14  2  0 13  8  5 ]
423
+C  [ 0  0  0  0  0  2  0  2  0  0  4  1  8 13 ]
424
+G  [14 20  0  0  0  1  0  4  1  0  0  3  3  0 ]
425
+T  [ 2  0 20 20  1  2 20  7  6 19 17  4  2  3 ]
426
+
271 427
 >MA0046.2	HNF1A
272 428
 A  [ 5209  6981   376  2914 14149 14149  1274  3340 14149   711    42 14149 14149  1488  3972 ]
273 429
 C  [ 2441   415  1060  2170     3   633   423  3750     9    13   228   237   695 14149  3427 ]
274 430
 G  [ 3490  7168   903   544   246     8     7  4540   339   845     4  1337  1095   655  2275 ]
275 431
 T  [ 3009   636 14149 14149    14   364 14149  2518   651 14149 14149  1638   174   914  4475 ]
276 432
 
433
+>MA0047.1	Foxa2
434
+A  [ 6 11  8  0 11  0  0  0  9  0  1  0 ]
435
+C  [ 7  3  3  1  0  1  1  0  0  9  1  5 ]
436
+G  [ 3  1  1  0  6  0  0  6  8  0  1  0 ]
437
+T  [ 1  2  5 16  0 16 16 11  0  8 14 12 ]
438
+
277 439
 >MA0047.2	Foxa2
278 440
 A  [  1 221   1   1   1 736   2 338  50 417 131 129 ]
279 441
 C  [  1   3   1   3   1   4 725  77 265   6  53 195 ]
280 442
 G  [  1 582   1  36 175  67   2   3  58  24 482 290 ]
281 443
 T  [805   3 806 769 634   3  81 391 436 360 140 189 ]
282 444
 
445
+>MA0048.1	NHLH1
446
+A  [13 13  3  1 54  1  1  1  0  3  2  5 ]
447
+C  [13 39  5 53  0  1 50  1  0 37  0 17 ]
448
+G  [17  2 37  0  0 52  3  0 53  8 37 12 ]
449
+T  [11  0  9  0  0  0  0 52  1  6 15 20 ]
450
+
283 451
 >MA0048.2	NHLH1
284 452
 A  [ 788  461    3 2166    0   96    0    2  296  308 ]
285 453
 C  [2166  179 2166    3  301 2166    4    4 2166  736 ]
... ...
@@ -292,6 +460,12 @@ C  [ 5  8  3  3  1  0  0  0  1  2 ]
292 460
 G  [ 8  2  4  1  0  0  0  2  0  2 ]
293 461
 T  [ 2  0  0  8  2  0  0  0  0  3 ]
294 462
 
463
+>MA0050.1	IRF1
464
+A  [ 6 19 19 20  5  0  1 20 19 20  1  1 ]
465
+C  [ 4  0  0  0  3 10  1  0  1  0 13 13 ]
466
+G  [10  1  0  0 11  0 18  0  0  0  6  1 ]
467
+T  [ 0  0  1  0  1 10  0  0  0  0  0  5 ]
468
+
295 469
 >MA0050.2	IRF1
296 470
 A  [ 316  251  173  138  735   24   12    0    0    0  913   20   16    7   11   17  513  218  145  198  166 ]
297 471
 C  [ 320  284  324  430  101  792    0   31   56 1249   39  787    1   14   58 1023  245  464  186  193  331 ]
... ...
@@ -304,6 +478,18 @@ C  [ 4  0  0  0  0  0  6  0  0  0  0  6  7  2  0  1  2  6 ]
304 478
 G  [ 7 10  0  0  0 10  0 12  0  0  0  6  2  3  2  1  1  1 ]
305 479
 T  [ 1  0  0  1  0  0  6  0  0  0  0  0  3  2  4  4  4  2 ]
306 480
 
481
+>MA0052.1	MEF2A
482
+A  [ 1  0 57  2  9  6 37  2 56  6 ]
483
+C  [50  0  1  1  0  0  0  0  0  0 ]
484
+G  [ 0  0  0  0  0  0  0  0  2 50 ]
485
+T  [ 7 58  0 55 49 52 21 56  0  2 ]
486
+
487
+>MA0052.2	MEF2A
488
+A  [ 481  169  116    0 1272 1008 1383 1352 1390    6 1472  231  587  530  345 ]
489
+C  [ 148  149 1179  473   68    0    0    5    0    0    0   49  632  409  449 ]
490
+G  [ 379  625   32    0   14  119   39    0    0    0    0 1160  112  110  203 ]
491
+T  [ 465  530  146 1000  119  346   51  116   83 1467    1   33  142  424  476 ]
492
+
307 493
 >MA0052.3	MEF2A
308 494
 A  [166  51   0 971 517 971 971 971   0 971 165 603 ]
309 495
 C  [ 86 971   9   3   0   2   0   4   2   2   5 368 ]
... ...
@@ -334,6 +520,18 @@ C  [ 4  0  1  0  0  2  0  1  0  2 ]
334 520
 G  [ 7  7  0 11 15 14 14  8  4  4 ]
335 521
 T  [ 4  7  0  5  1  0  2  4  2  2 ]
336 522
 
523
+>MA0058.1	MAX
524
+A  [ 6 11  5  0 16  0  1  0  0  6 ]
525
+C  [ 1  1  7 17  1 17  0  0  0  3 ]
526
+G  [ 6  5  1  0  0  0 16  0 17  5 ]
527
+T  [ 4  0  4  0  0  0  0 17  0  3 ]
528
+
529
+>MA0058.2	MAX
530
+A  [12557 13557  5014     0 24565     0 19618     0     0   122 ]
531
+C  [  741  1112  3587 24565     0 24565     0     0     0  2889 ]
532
+G  [ 8243  6781 12571     0     0     0  4947     0 24565 14194 ]
533
+T  [ 3024  3115  3393     0     0     0     0 24565     0  7360 ]
534
+
337 535
 >MA0058.3	MAX
338 536
 A  [3307 1915   39 6876    0  329   69    0 1341 1122 ]
339 537
 C  [1556 2809 6876    0 6876   39  159   27 2450 2225 ]
... ...
@@ -346,12 +544,24 @@ C  [ 1  1  9 20  0 20  0  1  0  1  5 ]
346 544
 G  [ 9  4  9  0  0  0 20  0 21 18  0 ]
347 545
 T  [ 4  1  1  0  0  1  0 20  0  1 13 ]
348 546
 
547
+>MA0060.1	NFYA
548
+A  [ 34  16   7  58  51   0   2 112 116   0  14  66  13  39  36  25 ]
549
+C  [ 37  33  51  14   4 116 113   0   0   1  65   6  20  43   9  35 ]
550
+G  [ 27  26  25  41  56   0   1   1   0   0  33  42  73  22  47  29 ]
551
+T  [ 18  41  33   3   5   0   0   3   0 115   4   2  10  12  24  27 ]
552
+
349 553
 >MA0060.2	NFYA
350 554
 A  [4708 1187 3548 1203 1826  192  237   16  222 8555    5   10   29   12  377  460 1537 4261 ]
351 555
 C  [1515  987 2256 2973 2344  834 7384  993 1018    2   52    5   10   70 2677 3943 4176 1136 ]
352 556
 G  [ 983 4580 2168 3978  313 4788  481  242 7181  150    8    5 8720 8683   15 1873 2227 2707 ]
353 557
 T  [1562 2014  796  614 4285 2954  666 7517  347   61 8703 8748    9    3 5699 2492  828  664 ]
354 558
 
559
+>MA0062.1	GABPA
560
+A  [5 1 1 0 0 7 7 0 3 0 ]
561
+C  [1 5 6 0 0 0 0 0 1 2 ]
562
+G  [1 1 0 7 7 0 0 7 1 4 ]
563
+T  [0 0 0 0 0 0 0 0 2 1 ]
564
+
355 565
 >MA0062.2	Gabpa
356 566
 A  [ 32  70   0   0 991 989  94  56 154 264 233 ]
357 567
 C  [768 914   0   0   1   2  32 261 137 262 357 ]
... ...
@@ -370,6 +580,12 @@ C  [ 0  0  0  0  9 ]
370 580
 G  [ 0  0  0 16  1 ]
371 581
 T  [ 0  0  0  0  5 ]
372 582
 
583
+>MA0065.1	PPARG::RXRA
584
+A  [10  7 19 13 17  0  0  0  2 41 41 39  0  0  0  2 38 10 13  7 ]
585
+C  [12 13  4  1  0  0  0  2 37  0  0  0  0  0  2 36  1 12 15 10 ]
586
+G  [ 7  8  6 27 24 41 39  0  2  0  0  2 41 39  0  1  2  4  9 12 ]
587
+T  [12 13 12  0  0  0  2 39  0  0  0  0  0  2 39  2  0 15  4 12 ]
588
+
373 589
 >MA0065.2	Pparg::Rxra
374 590
 A  [ 94 101 390 100 139 145  71 819 522 713  82  41  22  54 676 ]
375 591
 C  [317 166  23   3  15 129 547  21  48   5   2   9  99 555  58 ]
... ...
@@ -388,6 +604,12 @@ C  [ 7  1  2 28  1 17  0 11 ]
388 604
 G  [ 5 21  0  1  3  1 19 11 ]
389 605
 T  [ 9  2 26  2  1 11 10  8 ]
390 606
 
607
+>MA0068.1	Pax4
608
+A  [ 7 20 16 11 13 11  6  9  5  5  6  7  8  6 10  4  3  7  4  9  5  5  7  6  3  7  3  1  6  3 ]
609
+C  [ 2  0  2  1  1  3  1  1  3 11 11  7  7  5  5  8  6  8  9  6  7  6 11  9 12  9 12 11 11 13 ]
610
+G  [11  1  1  1  3  1  2  1  6  1  4  5  2  1  4  4  4  3  3  2  5  2  0  1  2  2  2  3  1  2 ]
611
+T  [ 1  0  2  8  4  6 12 10  7  4  0  2  4  9  2  5  8  3  5  4  4  8  3  5  4  3  4  6  3  3 ]
612
+
391 613
 >MA0068.2	PAX4
392 614
 A  [ 37  58 333 333   0  18 333 150 ]
393 615
 C  [333  30   2   0   0  11  89  93 ]
... ...
@@ -430,12 +652,24 @@ C  [ 0  0  0  0  9  0  2  4  0  0  0  0  0  9  1 ]
430 652
 G  [ 7 10  9  0  0  1  0  2  8  5 10  0  0  0  2 ]
431 653
 T  [ 0  0  1 10  1  0  4  2  0  0  0 10  9  1  0 ]
432 654
 
655
+>MA0075.1	Prrx2
656
+A  [52 59  0  0 58 ]
657
+C  [ 2  0  0  0  0 ]
658
+G  [ 4  0  1  0  1 ]
659
+T  [ 1  0 58 59  0 ]
660
+
433 661
 >MA0075.2	Prrx2
434 662
 A  [ 644  407 3849 3849   13  466 3849 1234 ]
435 663
 C  [1522 2052  361  232   22  504  198  878 ]
436 664
 G  [ 715  250  412  124   11  239   39 1035 ]
437 665
 T  [ 969 1797  298   70 3849 3849  400  702 ]
438 666
 
667
+>MA0076.1	ELK4
668
+A  [16  0  0  0  0 20 16  4  1 ]
669
+C  [ 1 20 20  0  0  0  0  1  6 ]
670
+G  [ 2  0  0 20 20  0  0 15  0 ]
671
+T  [ 1  0  0  0  0  0  4  0 13 ]
672
+
439 673
 >MA0076.2	ELK4
440 674
 A  [ 298  391 2034    0    8    0    0    0    0    0  290 ]
441 675
 C  [1458 1905  145 2688    0    0 3427 3427    0  501 1253 ]
... ...
@@ -454,12 +688,42 @@ C  [ 9  8 18  0  1  0  0  0 17 ]
454 688
 G  [ 6  4  1  0  0  0 31  2 10 ]
455 689
 T  [ 9 11  9  1 30 31  0 29  4 ]
456 690
 
691
+>MA0079.1	SP1
692
+A  [1 2 0 0 0 2 0 0 1 2 ]
693
+C  [1 1 0 0 5 0 1 0 1 0 ]
694
+G  [4 4 8 8 2 4 5 6 6 0 ]
695
+T  [2 1 0 0 1 2 2 2 0 6 ]
696
+
697
+>MA0079.2	SP1
698
+A  [ 0  0  0  4  2  0  1  0  6  3 ]
699
+C  [32 30 35 27  5 28 31 24 25 26 ]
700
+G  [ 1  1  0  0 15  1  0  3  0  3 ]
701
+T  [ 2  4  0  4 13  6  3  8  4  3 ]
702
+
457 703
 >MA0079.3	SP1
458 704
 A  [ 857    0   99    0    0 1359    0    0    0 1054  652 ]
459 705
 C  [1786 6215 6703 8734 8661    0 8734 8734 6679 6357 4969 ]
460 706
 G  [4271  642    0    0    0 4624    0    0    0    0  734 ]
461 707
 T  [1820 1877 1932    0   73 2751    0    0 2055 1323 2379 ]
462 708
 
709
+>MA0080.1	SPI1
710
+A  [14  4  3 56 56  3 ]
711
+C  [21  2  0  1  0 18 ]
712
+G  [19 48 52  0  0 34 ]
713
+T  [ 3  3  2  0  1  2 ]
714
+
715
+>MA0080.2	SPI1
716
+A  [33  4  4 42 41  5  3 ]
717
+C  [ 3  0  0  0  0  3  5 ]
718
+G  [ 6 37 38  0  1 33  2 ]
719
+T  [ 0  1  0  0  0  1 32 ]
720
+
721
+>MA0080.3	Spi1
722
+A  [24957 27071 38966 42251 38682 12577 45356  4801     0 63665 63715  3436  8250  3893 21911 ]
723
+C  [10470  7875  3311  3103   534  8120  3209     0     0     0     0 10145  3223 12038 12028 ]
724
+G  [17557 22021 13786 12032 11483 43018 14683 58914 63715    50     0 50134  3385 45501 21003 ]
725
+T  [10731  6748  7652  6329 13016     0   467     0     0     0     0     0 48857  2283  8773 ]
726
+
463 727
 >MA0080.4	SPI1
464 728
 A  [3946 4976 5053 5044 4868   49 1793   29    0 5105 5122    0   21 2535 ]
465 729
 C  [ 555   26    2    0    4  246 4068    1    1    2    1  184   69  288 ]
... ...
@@ -478,6 +742,18 @@ C  [14 22  0  2  0  0  1  0  1  1  5  5  2  5 ]
478 742
 G  [ 1  0  4  1  0  0  0  1 15 28  1  0  3  8 ]
479 743
 T  [ 4  8  2 11  7 13  5 21  0  0 10  0  4 10 ]
480 744
 
745
+>MA0083.1	SRF
746
+A  [ 2  9  0  1 32  3 46  1 43 15  2  2 ]
747
+C  [ 1 33 45 45  1  1  0  0  0  1  0  1 ]
748
+G  [39  2  1  0  0  0  0  0  0  0 44 43 ]
749
+T  [ 4  2  0  0 13 42  0 45  3 30  0  0 ]
750
+
751
+>MA0083.2	SRF
752
+A  [ 426 1017  515  270  477   49    0 1767 1184 2226  590 2048 1452   68   15  608 1353 1299 ]
753
+C  [ 813  446  285  257  681 2144 2105   66    0    0  120   12   10    0    7  864  504  178 ]
754
+G  [ 281  331  206 1000  533    0    0   23   73   16   16   51   87 2209 2255  441  230  460 ]
755
+T  [ 757  483 1271  750  586   84  172  421 1020   35 1551  166  728    0    0  364  190  340 ]
756
+
481 757
 >MA0083.3	SRF
482 758
 A  [ 214   75  627    0    3 1137   54 1163    1 1162  439    8    8  262  337  913 ]
483 759
 C  [ 125  152  611 1771 1787   13    0    0    5    0   12    9    2  105 1023   63 ]
... ...
@@ -508,6 +784,12 @@ C  [ 0  0  0  0  1  1  3 ]
508 784
 G  [ 0  1  0 22  0  0  4 ]
509 785
 T  [ 0 22 23  0 22 21  8 ]
510 786
 
787
+>MA0088.1	znf143
788
+A  [ 0  6  2  0  2  1  0  0  9  0  4  6  0  0  0  4  3  2  1  3 ]
789
+C  [ 3  2  3  3  1  7 10 10  1  1  4  2  0  1 10  5  1  3  1  6 ]
790
+G  [ 4  1  1  2  0  0  0  0  0  4  2  2  1  6  0  0  1  0  7  1 ]
791
+T  [ 3  1  4  5  7  2  0  0  0  5  0  0  9  3  0  1  5  5  1  0 ]
792
+
511 793
 >MA0088.2	ZNF143
512 794
 A  [  87  949   21    2    0 1609    0 1295 1572    6   59    0 1503  345  102  382 ]
513 795
 C  [ 509    0 1590 1609 1609    0  917  143    0    0   36 1609  153 1067 1138   21 ]
... ...
@@ -520,6 +802,12 @@ C  [11  2  0  0  0 26 ]
520 802
 G  [10  3  0 32  0  2 ]
521 803
 T  [ 6  0 34  1  0  6 ]
522 804
 
805
+>MA0090.1	TEAD1
806
+A  [ 1  9  0 12  0  0  0  0  5  1  2  0 ]
807
+C  [ 6  0 12  0  0  0 12 11  0  7  4  2 ]
808
+G  [ 1  3  0  0  0  0  0  0  0  4  3  8 ]
809
+T  [ 4  0  0  0 12 12  0  1  7  0  3  2 ]
810
+
523 811
 >MA0090.2	TEAD1
524 812
 A  [ 218  734  212 1132    0  265   29    0  621  280 ]
525 813
 C  [ 454  100  920   63   10   33 1132 1132  109  346 ]
... ...
@@ -538,18 +826,36 @@ C  [ 8  0  2 28  0  0  3 14  0  4 ]
538 826
 G  [10 15  1  0  0 29 25  1  3  4 ]
539 827
 T  [ 7  4 24  1 29  0  1  5 10 16 ]
540 828
 
829
+>MA0093.1	USF1
830
+A  [ 0 30  0  1  0  0  9 ]
831
+C  [30  0 28  0  1  0  2 ]
832
+G  [ 0  0  0 29  1 30 14 ]
833
+T  [ 0  0  2  0 28  0  5 ]
834
+
541 835
 >MA0093.2	USF1
542 836
 A  [ 4846  1472    43 16573   188  1605     0     0 14762     0  1821 ]
543 837
 C  [ 3764  7448 16799     0 10279   595     0     0     0 13166  9926 ]
544 838
 G  [ 7162  2983     0     0   932 14642     0 16842  1375     0  1113 ]
545 839
 T  [ 1070  4939     0   269  5443     0 16842     0   705  3676  3982 ]
546 840
 
841
+>MA0094.1	Ubx
842
+A  [ 3 72 79  1 ]
843
+C  [ 0  4  1  5 ]
844
+G  [ 0  3  6  4 ]
845
+T  [85  9  2 78 ]
846
+
547 847
 >MA0094.2	Ubx
548 848
 A  [ 3  0  0 17 20  0  0 14 ]
549 849
 C  [ 5  0  0  0  0  0  0  0 ]
550 850
 G  [ 3  0  0  0  0  0  6  6 ]
551 851
 T  [ 9 20 20  3  0 20 14  0 ]
552 852
 
853
+>MA0095.1	YY1
854
+A  [ 6  0  0 17  0  3 ]
855
+C  [ 1 16 17  0  0  8 ]
856
+G  [ 7  0  0  0  0  3 ]
857
+T  [ 3  1  0  0 17  3 ]
858
+
553 859
 >MA0095.2	YY1
554 860
 A  [1126 6975 6741 2506 7171    0   11   13  812  867  899 1332 ]
555 861
 C  [4583    0   99 1117    0   12    0    0 5637 1681  875 4568 ]
... ...
@@ -568,18 +874,42 @@ C  [ 0  0  0  0  0 33  0  0  1  0 20 32 ]
568 874
 G  [31 16  0 33  0  0 33  0 32 22  1  0 ]
569 875
 T  [ 1  0 33  0  0  0  0 33  0 10  1  0 ]
570 876
 
877
+>MA0098.1	ETS1
878
+A  [ 4 17  0  0  0  5 ]
879
+C  [16  0  1 39 39  3 ]
880
+G  [ 4  0  0  1  0 17 ]
881
+T  [16 23 39  0  1 15 ]
882
+
883
+>MA0098.2	Ets1
884
+A  [ 431  145  263 1179    0  329    0    0    0    0    0   65  146  306  265 ]
885
+C  [ 668 1160  993  117 1507    0    0 1868 1868    0  329  579  678  542  629 ]
886
+G  [ 420  244  187  451    4    0    0    0    0  156 1422   62  437  309  472 ]
887
+T  [ 349  319  425  121  357 1539 1868    0    0 1712  117 1162  607  711  502 ]
888
+
571 889
 >MA0098.3	ETS1
572 890
 A  [2683  180  425    0    0 2683 2683 1102   89  803 ]
573 891
 C  [ 210 2683 2683   21    0    0    9   21  712  401 ]
574 892
 G  [ 640  297    7 2683 2683    0   31 1580  124 1083 ]
575 893
 T  [ 241   22    0    0   12    0  909   12 1970  396 ]
576 894
 
895
+>MA0099.1	JUN::FOS
896
+A  [ 5  0  0 18  1  1  6 18 ]
897
+C  [ 2  0  1  1  6  1 13  0 ]
898
+G  [12  0 18  0  9  0  0  0 ]
899
+T  [ 0 19  0  0  3 17  0  1 ]
900
+
577 901
 >MA0099.2	FOS::JUN
578 902
 A  [ 0  0 16  5  3  0 16 ]
579 903
 C  [ 1  0  2 12  0 15  0 ]
580 904
 G  [ 0 15  0  1  1  3  1 ]
581 905
 T  [17  3  0  0 14  0  1 ]
582 906
 
907
+>MA0100.1	Myb
908
+A  [ 8 22  2 16  1  2  0  6 ]
909
+C  [ 4  1 48 17  0  1  0  0 ]
910
+G  [34 25  1 16 50  0  0 44 ]
911
+T  [ 5  3  0  2  0 48 51  1 ]
912
+
583 913
 >MA0100.2	Myb
584 914
 A  [ 89 227 979 910   0  53   0 150  30 725 ]
585 915
 C  [374 452   0   0 979   0   0 416 949   8 ]
... ...
@@ -592,30 +922,90 @@ C  [ 5  1  0  1  5  1  0  0 15 16 ]
592 922
 G  [ 8 15 15  9  3  1  0  0  0  0 ]
593 923
 T  [ 4  1  1  2  3 10 16 15  2  0 ]
594 924
 
925
+>MA0102.1	Cebpa
926
+A  [ 3  1  4  2  4  2 18 18  0  5  2  1 ]
927
+C  [ 0  1  1  9  2 15  0  0  6  6  5  6 ]
928
+G  [ 0  4  6  2 10  0  0  0  2  5  3  5 ]
929
+T  [15 12  7  5  2  1  0  0 10  2  8  6 ]
930
+
931
+>MA0102.2	CEBPA
932
+A  [ 3  1  4  2  4  2 18 18  0 ]
933
+C  [ 0  1  1  9  2 15  0  0  6 ]
934
+G  [ 0  4  6  2 10  0  0  0  2 ]
935
+T  [15 12  7  5  2  1  0  0 10 ]
936
+
595 937
 >MA0102.3	CEBPA
596 938
 A  [10351     0     0   705     0 11956  2660 12226 15318     0  5804 ]
597 939
 C  [ 1332     0     0     0 15318  1274  7654  3092     0  5688  4963 ]
598 940
 G  [ 3635     0     0 11304     0  1066     0     0     0  1804   890 ]
599 941
 T  [    0 15318 15318  3309     0  1022  5004     0     0  7826  3661 ]
600 942
 
943
+>MA0103.1	ZEB1
944
+A  [ 1 38  0  0  0 10 ]
945
+C  [34  0 40 38  1  1 ]
946
+G  [ 1  2  1  3  0 16 ]
947
+T  [ 5  1  0  0 40 14 ]
948
+
601 949
 >MA0103.2	ZEB1
602 950
 A  [ 856    0 1197    0 3555    0    0    0    0 ]
603 951
 C  [1455 2991  333 3170    0 3555 3555    0    0 ]
604 952
 G  [ 830    0  431    0    0    0    0    0 3555 ]
605 953
 T  [ 414  564 1594  385    0    0    0 3555    0 ]
606 954
 
955
+>MA0104.1	Mycn
956
+A  [ 0 29  0  2  0  0 ]
957
+C  [31  0 30  1  3  0 ]
958
+G  [ 0  0  0 28  0 31 ]
959
+T  [ 0  2  1  0 28  0 ]
960
+
961
+>MA0104.2	Mycn
962
+A  [153  39   7 414   0  31  24   0  27  61 ]
963
+C  [159 170 431   0 421   1  97   0  49 265 ]
964
+G  [ 63 196   0  18   8 405   2 411 324  40 ]
965
+T  [ 63  33   0   6   9   1 315  27  38  72 ]
966
+
607 967
 >MA0104.3	Mycn
608 968
 A  [ 528    0    0 1403    0  168    0    0 ]
609 969
 C  [ 146 1135 1403    0 1403    0    0    0 ]
610 970
 G  [ 566  268    0    0    0 1235    0 1403 ]
611 971
 T  [ 163    0    0    0    0    0 1403    0 ]
612 972
 
973
+>MA0105.1	NFKB1
974
+A  [ 0  0  1 25 19  7  1  2  2  0 ]
975
+C  [ 0  0  0  0 13  1  2 17 35 36 ]
976
+G  [38 38 37 13  1  3  2  0  0  0 ]
977
+T  [ 0  0  0  0  5 27 33 19  1  2 ]
978
+
979
+>MA0105.2	NFKB1
980
+A  [ 0  0  0  2 11  5  0  0  0  0  1 ]
981
+C  [ 0  0  0  0  1  0  5 13 17 18 15 ]
982
+G  [18 18 18 16  6  2  2  0  0  0  1 ]
983
+T  [ 0  0  0  0  0 11 11  5  1  0  1 ]
984
+
985
+>MA0105.3	NFKB1
986
+A  [ 570   55  121 3141 2228    0    0    0    0    0 1580 ]
987
+C  [ 319    0    0  224 1204    0   55 1526 4858 5026 2395 ]
988
+G  [2682 5057 4902 1635  812    0   84    0    0    0  269 ]
989
+T  [1541    0   89  112  868 5112 4973 3586  254   86  868 ]
990
+
613 991
 >MA0105.4	NFKB1
614 992
 A  [ 8441     9     0     4   229 12004  7003    22    17   497     4     6  1231 ]
615 993
 C  [ 2013     0     3     0     3    62    18  1311  9574  9536  9591  9642  1293 ]
616 994
 G  [  990 19047 19177 19167 19458   821    32   116     4     1     1     2  3348 ]
617 995
 T  [  818     5     2   318    27    27  6744 14372   130     3     2     8  9386 ]
618 996
 
997
+>MA0106.1	TP53
998
+A  [ 5  3  4  5 13  0 17  0  0  0  0  0  1  1  4  1 15  2  1  1 ]
999
+C  [ 8  7  0  0  0 17  0  0  0 11 16 16  0  0  0 14  0  0  1  2 ]
1000
+G  [ 2  6 13 12  4  0  0  0 17  0  0  0 15 14 13  2  0  0 14  1 ]
1001
+T  [ 2  1  0  0  0  0  0 17  0  6  1  1  1  2  0  0  2 15  1 13 ]
1002
+
1003
+>MA0106.2	TP53
1004
+A  [ 736    3  963  269    0   73  175   80  810  337  837    0 1013  178   36 ]
1005
+C  [   0 1191   45   11    0  597  818  919  162   45    0 1226   26   43    6 ]
1006
+G  [ 469    5   29   33 1231    0   47   52   87  790  377    3   12   25 1186 ]
1007
+T  [  26   32  194  918    0  561  191  180  172   59   17    2  180  985    3 ]
1008
+
619 1009
 >MA0106.3	TP53
620 1010
 A  [ 7544 10514    45 11931  1710     8   244  1228  1145  3851  3584  7104     0 12925  1825   327   879  1472 ]
621 1011
 C  [ 1037   116 19689   204   374     2 12014 17286 11875  1474   756    26 19350   250   118    33  3338  9183 ]
... ...
@@ -628,6 +1018,12 @@ C  [ 4  0  0  0  3  0  0  2 18 18 ]
628 1018
 G  [11 17 18  7  4  0  0  0  0  0 ]
629 1019
 T  [ 3  1  0  0  1 16 18 16  0  0 ]
630 1020
 
1021
+>MA0108.1	TBP
1022
+A  [ 61  16 352   3 354 268 360 222 155  56  83  82  82  68  77 ]
1023
+C  [145  46   0  10   0   0   3   2  44 135 147 127 118 107 101 ]
1024
+G  [152  18   2   2   5   0  10  44 157 150 128 128 128 139 140 ]
1025
+T  [ 31 309  35 374  30 121   6 121  33  48  31  52  61  75  71 ]
1026
+
631 1027
 >MA0108.2	TBP
632 1028
 A  [ 61  16 352   3 354 268 360 222 155  56  83  82  82  68  77 ]
633 1029
 C  [145  46   0  10   0   0   3   2  44 135 147 127 118 107 101 ]
... ...
@@ -640,6 +1036,12 @@ C  [10 12 33 59  0  0  5  0 14 12 ]
640 1036
 G  [12  5  0  0  0  0 12 22 14 10 ]
641 1037
 T  [13 16  0  0 34 59 18 37  8 15 ]
642 1038
 
1039
+>MA0110.1	ATHB-5
1040
+A  [ 3  1 30 37  0  2 37  0  0 ]
1041
+C  [19 29  6  0  0  5  0  0  0 ]
1042
+G  [ 9  4  0  0  0 10  0  0  0 ]
1043
+T  [ 6  3  1  0 37 20  0 37 37 ]
1044
+
643 1045
 >MA0110.2	ATHB-5
644 1046
 A  [ 0  4  2  2  0 32 39  0  2 39  0  0  0 ]
645 1047
 C  [ 9  9 12 17 32  6  0  0  8  0  0  0  0 ]
... ...
@@ -652,18 +1054,54 @@ C  [ 0  2  0  0  0  0  0  9  0  1  8 ]
652 1054
 G  [ 3  9 10 11  1  0  2  2  2  9  2 ]
653 1055
 T  [ 0  1  0  1 10  4  4  0  0  2  0 ]
654 1056
 
1057
+>MA0112.1	ESR1
1058
+A  [1 1 7 2 0 0 0 6 1 2 3 1 1 5 0 0 2 3 ]
1059
+C  [5 5 1 0 0 0 7 0 7 5 2 1 0 1 8 9 4 4 ]
1060
+G  [1 1 1 7 9 0 2 2 1 1 4 1 8 3 0 0 0 1 ]
1061
+T  [2 2 0 0 0 9 0 1 0 1 0 6 0 0 1 0 3 1 ]
1062
+
1063
+>MA0112.2	ESR1
1064
+A  [122 107  64  83 134 308  36  19  33   4 398  58  63  64  32  21 305  10  59  26 ]
1065
+C  [120  80 173 229 232  28   8  18  41 394  13 250 276 258  19  22 106 436 353 165 ]
1066
+G  [154 164 149  65  47  89 387 420  91  53  27 107  53  97   8 426  31  12   2  22 ]
1067
+T  [ 71 117  82  93  57  48  43  18 310  24  37  60  83  56 416   6  33  17  61 262 ]
1068
+
655 1069
 >MA0112.3	ESR1
656 1070
 A  [232 402   0   2   0   1 471 108 127 235   0   2 491   0  15   0  35 ]
657 1071
 C  [ 65   6   0   0   0 452   0 338 223  88  23   0   1 460 455 143  68 ]
658 1072
 G  [101 206 623 638   3   0  30  53 340 284   1 632   1   2   0   7 209 ]
659 1073
 T  [ 88   0  34   0 549   2   0  23  65  13 510   0   0   0   0 502 204 ]
660 1074
 
1075
+>MA0113.1	NR3C1
1076
+A  [3 4 3 7 6 1 8 2 3 5 1 0 1 2 0 1 4 3 ]
1077
+C  [2 0 0 0 1 6 0 0 2 3 3 0 0 4 8 2 0 1 ]
1078
+G  [4 5 6 1 1 2 1 2 0 0 0 8 0 0 1 1 4 2 ]
1079
+T  [0 0 0 1 1 0 0 5 4 1 5 1 8 3 0 5 1 3 ]
1080
+
1081
+>MA0113.2	NR3C1
1082
+A  [248  70 207 401   0 385 152 234 249 108   0  47 120   0  60 ]
1083
+C  [  0   0  94   0 465   0 136  71 107   0   0   8 162 407 150 ]
1084
+G  [150 370 109  36   0  14 177  81 109  19 465   0   0   0   0 ]
1085
+T  [ 67  25  55  28   0  66   0  79   0 338   0 410 183  58 255 ]
1086
+
661 1087
 >MA0113.3	NR3C1
662 1088
 A  [ 6520  8885    40  8932 18207     0 18421  2470  7736 11413    81     0     8  8832    33   234  6219 ]
663 1089
 C  [ 2274   107     7   599     8 24481    18  9569  3656   964   565    11     9  3149 24380 14665  8912 ]
664 1090
 G  [ 9169 12768 27337  2854     9    14   698  1583  5589  7861    50 27160    50   648     5   188  3101 ]
665 1091
 T  [ 4861   225    38 10448    10     0    71 10711  5972  1822 23751     5 24434 10375    58  9821  5075 ]
666 1092
 
1093
+>MA0114.1	HNF4A
1094
+A  [28  2 12  5  3 59 53 56  4  6  3  4 42 ]
1095
+C  [ 7  2  4 23 51  1  2  1  4  2 22 49  7 ]
1096
+G  [27 56 35 20  4  3 10  8 58 33 11  5 10 ]
1097
+T  [ 5  7 16 19  9  4  2  2  1 26 31  9  8 ]
1098
+
1099
+>MA0114.2	HNF4A
1100
+A  [ 2766  1731   837  6075 11026   117    26   178     0   864  5270  6119  1156  1870  2070 ]
1101
+C  [ 5971   720    51  1846  4425 16535  1630  2637   173    35  3745  5653 13491  6498  6450 ]
1102
+G  [ 3974   907 15810  8370   329    67     0   367   407 15741  5340  1662   352   415  3001 ]
1103
+T  [ 4057 13410    70   477   988    49 15112 13586 16188   128  2413  3334  1769  7985  5247 ]
1104
+
667 1105
 >MA0114.3	Hnf4a
668 1106
 A  [1870 1624    6  211  148    1 5162 5162 5162    0    0  129    0 4452 2148 1019 ]
669 1107
 C  [ 587   23    0   14   66 5162    2    0    0    1    5 5162 5162   35 1109 1064 ]
... ...
@@ -682,6 +1120,12 @@ C  [ 4 16 17 16 33 33 17  0  0  0  0  0  0  8 22 ]
682 1120
 G  [22 17  0  0  0  0  0  0 16 33 33 17 16 16  0 ]
683 1121
 T  [ 0  0  0  0  0  0 15  9  4  0  0 16 17  9  0 ]
684 1122
 
1123
+>MA0117.1	Mafb
1124
+A  [ 0  1  0  1 12  3  3  2 ]
1125
+C  [ 0 12  3  0  2  8  1  5 ]
1126
+G  [15  1  1 12  0  1  7  5 ]
1127
+T  [ 0  1 11  2  1  3  4  3 ]
1128
+
685 1129
 >MA0117.2	Mafb
686 1130
 A  [1237 1263 1080  744  264    2  295   31   45 2182  182  582 ]
687 1131
 C  [ 174  121  216  398  618   14 2182   36   13   13 2182  138 ]
... ...
@@ -712,6 +1156,12 @@ C  [ 1  0  0  0  6  8  0  6 ]
712 1156
 G  [ 0 15  1  0  0  0  9  4 ]
713 1157
 T  [ 0  0  0 15  5  6  6  2 ]
714 1158
 
1159
+>MA0122.1	Nkx3-2
1160
+A  [ 4  1 13 24  0  0  6  4  9 ]
1161
+C  [ 7  4  1  0  0  0  0  6  7 ]
1162
+G  [ 4  5  7  0 24  0 18 12  5 ]
1163
+T  [ 9 14  3  0  0 24  0  2  3 ]
1164
+
715 1165
 >MA0122.2	NKX3-2
716 1166
 A  [2202 1715   21 5712  170    5   26 5712 5712 ]
717 1167
 C  [1032 5712 5712  105 5712   36  197  357 1339 ]
... ...
@@ -724,6 +1174,12 @@ C  [49  0 20 23  3 45 28 25 31 26 ]
724 1174
 G  [ 0 37 29  1 45  4  6 11  5  7 ]
725 1175
 T  [ 0  0  0 25  0  0 10 10 10 12 ]
726 1176
 
1177
+>MA0124.1	NKX3-1
1178
+A  [13  0 20  0  1  1 19 ]
1179
+C  [ 1  1  0 19  0  0  0 ]
1180
+G  [ 3  0  0  0  0  0  1 ]
1181
+T  [ 3 19  0  1 19 19  0 ]
1182
+
727 1183
 >MA0124.2	Nkx3-1
728 1184
 A  [2438  981    0 5335   59    0    0 5335 5335 ]
729 1185
 C  [ 991 5335 5335   28 5335    1  254  273 1407 ]
... ...
@@ -766,12 +1222,24 @@ C  [ 6  2 16 16  0 15 ]
766 1222
 G  [ 3  0  0  0  0  1 ]
767 1223
 T  [ 0 11  0  0  0  0 ]
768 1224
 
1225
+>MA0131.1	HINFP
1226
+A  [ 2 13 20  2  0  0  0  0  0  2 ]
1227
+C  [ 6  1  0 17  0  1 19 18  0 13 ]
1228
+G  [ 5  0  0  1 19  0  0  2 19  1 ]
1229
+T  [ 7  6  0  0  1 19  1  0  1  4 ]
1230
+
769 1231
 >MA0131.2	HINFP
770 1232
 A  [ 23 285 276   1   0   0   0   0   0   1  85  77 ]
771 1233
 C  [340 131  45 388  14   0 404 413  31 395  55  84 ]
772 1234
 G  [106 113 217  97 484   0  13   0 472  15 188 154 ]
773 1235
 T  [100  53  17   7  10 470   0   3  21  12  97 107 ]
774 1236
 
1237
+>MA0132.1	Pdx1
1238
+A  [ 1  0 31 31  0  1 ]
1239
+C  [19  0  0  0  0  1 ]
1240
+G  [ 5  0  0  0  1 10 ]
1241
+T  [ 6 31  0  0 30 19 ]
1242
+
775 1243
 >MA0132.2	PDX1
776 1244
 A  [1483  292 4839 7130    0    0 7130 2181 ]
777 1245
 C  [2206 2469 2291   45    0    0    0 1216 ]
... ...
@@ -784,18 +1252,42 @@ C  [ 0  2  0  0  0  0  0  2  1  1  0  8  9 ]
784 1252
 G  [ 3  2  0  0  0  0  0  0  0  0  3  0  3 ]
785 1253
 T  [ 8  0  1 20 20  1  0 16 19  3  8 10  6 ]
786 1254
 
1255
+>MA0136.1	ELF5
1256
+A  [12 29  2 14  0  0  0  4  4 ]
1257
+C  [ 9  3 20  0  1 44 44  3  8 ]
1258
+G  [ 3  7  5  1  0  0  0 11 11 ]
1259
+T  [20  5 17 29 43  0  0 26 21 ]
1260
+
787 1261
 >MA0136.2	ELF5
788 1262
 A  [2416 1221  987 1458    3    5 2699 2646  890  477  959 ]
789 1263
 C  [ 252 2298 2453 2528    0    0   11   61  155  716  371 ]
790 1264
 G  [ 301  955 1266  309 3307 3315    1    0 2857  312  762 ]
791 1265
 T  [ 793  866   97   56   20   25    4  245   84 2470  663 ]
792 1266
 
1267
+>MA0137.1	STAT1
1268
+A  [ 5  2 11 15 14  8  1  0 15 15 15  0  1  4 ]
1269
+C  [ 1  0  0  0  1  3  6  0  0  0  0 14  3  2 ]
1270
+G  [ 9 13  4  0  0  3  2 15  0  0  0  1  0  7 ]
1271
+T  [ 0  0  0  0  0  1  6  0  0  0  0  0 11  2 ]
1272
+
1273
+>MA0137.2	STAT1
1274
+A  [ 208  859  251   10    8  106   23  528  696   53 1900 2030  954  336  417 ]
1275
+C  [1076  496  574   22   14 1921 1900  762   31   30  124   17  263  760  804 ]
1276
+G  [ 415  279  144   11   38   14    7  115 1292 1700   29   23  552  270  425 ]
1277
+T  [ 378  446 1112 2038 2023   44  155  680   66  302   32   15  315  714  431 ]
1278
+
793 1279
 >MA0137.3	STAT1
794 1280
 A  [ 366    0    0  361  109 1739  163   29 3620 3624 1879 ]
795 1281
 C  [ 731   52    6 3262 2009    0    0    7    0    5  311 ]
796 1282
 G  [ 785    0  110    6    0 1637 3466 3426    9    0  725 ]
797 1283
 T  [1747 3577 3513    0 1511  253    0  167    0    0  714 ]
798 1284
 
1285
+>MA0138.1	REST
1286
+A  [ 1  7  1  0  0  1  0  0  0 11  5  2  0  1  0  0  0  1 15 ]
1287
+C  [ 2  9  3 22  1  4  0 19 21  3  1  0  1  0  3 21  1  1  1 ]
1288
+G  [15  1 15  0  0 17  2  1  0  5  3 20 21  1 16  0  0 20  5 ]
1289
+T  [ 4  5  3  0 21  0 20  2  1  3 13  0  0 20  3  1 21  0  1 ]
1290
+
799 1291
 >MA0138.2	REST
800 1292
 A  [ 211   58   76 1452   34  122 1575    3   35  913  219   39   20 1406   13 1574   42  205  366  213  179 ]
801 1293
 C  [ 174  269 1366   30   44  978    7 1586 1481  201  375    7    5  112 1280    9   13 1007   31  933 1114 ]
... ...
@@ -808,12 +1300,30 @@ C  [291 145  49 800 903  13 528 433  11   0   3  12   0   8 733  13 482 322 181
808 1300
 G  [ 76 414 449  21   0  65 334  48  32 903 566 504 890 775   5 507 307  73 266 ]
809 1301
 T  [459 187 134  36   2  91  11 324  18   3   9 341   8  71  67  17  37 396  59 ]
810 1302
 
1303
+>MA0140.1	Tal1::Gata1
1304
+A  [ 400  261  131  265  669  701  664  713  734  996  527 1959    3 2928   16 2770 2382  547 ]
1305
+C  [1329  444  182  746  635  687  745  699  662  407 1172   31    7    7   26    6   51  550 ]
1306
+G  [ 618  520 1921 1228  775  903  938  891  862  940  901   37 2936    2   30   23  376 1601 ]
1307
+T  [ 595 1717  710  706  866  654  599  644  691  603  345  920    0   10 2873  144  134  242 ]
1308
+
811 1309
 >MA0140.2	GATA1::TAL1
812 1310
 A  [1114  206  318 4955    0    0 2049  658  963 1191 1778 1038 1352 1885 1381  110 4659  160 ]
813 1311
 C  [2038  807    0    0    0 4955   63 1331 1214 1127 1130 1237 1142 1033 1237 4822    0  890 ]
814 1312
 G  [ 967  159    0    0    0    0   55 2214 1244 1520  990 1712 1466  820 1884   23    0 3544 ]
815 1313
 T  [ 836 3783 4637    0 4955    0 2788  752 1534 1117 1057  968  995 1217  453    0  296  361 ]
816 1314
 
1315
+>MA0141.1	Esrrb
1316
+A  [1054  673  420  259  310 3326 3567   32   21  182    9 3458 ]
1317
+C  [ 800  829 1211 1250 2664   32    2    5   12   46 3376   20 ]
1318
+G  [ 985 1370 1209  448  627  248   60 3586 3602  244  170  129 ]
1319
+T  [ 793  767  805 1693   52   50   27   31   17 3175   85   27 ]
1320
+
1321
+>MA0141.2	Esrrb
1322
+A  [1055  673  403  260  312 3347 3590   33   12  180    9 3478 ]
1323
+C  [ 801  832 1212 1230 2653   32    2    2   11   43 3394   21 ]
1324
+G  [ 984 1352 1212  449  630  248   60 3597 3622  243  167  128 ]
1325
+T  [ 773  767  807 1702   51   27    6   29   16 3192   85   26 ]
1326
+
817 1327
 >MA0141.3	ESRRB
818 1328
 A  [ 108    9 1746 1746    3    1    6    2 1746  702  692 ]
819 1329
 C  [ 373 1746    1    1    2    4   11 1746    0  256  328 ]
... ...
@@ -826,36 +1336,90 @@ C  [ 846   58   50   12  363   18  365   30    5   16 1029   16   68   33  119 ]
826 1336
 G  [  66   28   36   79  825   29  186   24   15 1239  129   30  315   75  207 ]
827 1337
 T  [ 389  701 1270 1231   63  907  612   80 1332  104  196  269   92   53  837 ]
828 1338
 
1339
+>MA0143.1	Sox2
1340
+A  [ 27  20 327   2  14  38  85  64 408  26  27  32 426 366 485 ]
1341
+C  [444 453   7  10   1  83   4 194 124  39  77 422  41  67  60 ]
1342
+G  [ 89  22   4   7   6 529   9  77  38  26 444  84  36 157  61 ]
1343
+T  [107 174 331 650 648  19 570 333  96 575 117 127 161  74  58 ]
1344
+
1345
+>MA0143.2	Sox2
1346
+A  [ 27  20 329   2  14  36  85  63 407  26  26  31 426 367 485 ]
1347
+C  [446 454   6  10   0  83   4 195 125  37  77 423  42  67  60 ]
1348
+G  [ 89  22   3   6   6 531   8  76  38  26 445  84  37 156  59 ]
1349
+T  [107 173 331 651 649  19 571 334  96 577 117 127 159  74  58 ]
1350
+
829 1351
 >MA0143.3	Sox2
830 1352
 A  [   0    0  669    0    0    0    0    0 ]
831 1353
 C  [1476 1476    0    0    0    0    0  419 ]
832 1354
 G  [   0    0    0    0    0 1476    0  297 ]
833 1355
 T  [   0    0  807 1476 1476    0 1476  760 ]
834 1356
 
1357
+>MA0144.1	Stat3
1358
+A  [ 20  13  38   6 321   8   6 585 606 191 ]
1359
+C  [ 19  10 552 541  21   0   2  21   1  15 ]
1360
+G  [ 25 129   9   1 148 605 592   7   5 393 ]
1361
+T  [549 461  14  65 123   0  13   0   1  14 ]
1362
+
835 1363
 >MA0144.2	STAT3
836 1364
 A  [ 1936   708   250  1006   840  3692  1574  2532 21620 21620  9311 ]
837 1365
 C  [ 8571     0   346 19585  7780     0     0     0     0     0   962 ]
838 1366
 G  [ 3801     0  5850     0     0 11456 20046 18686     0     0  6579 ]
839 1367
 T  [ 7312 20912 15174  1029 13000  6472     0   402     0     0  4768 ]
840 1368
 
1369
+>MA0145.1	Tcfcp2l1
1370
+A  [   8  285 2425   24  717  402  711 1461 2583 1612   15  252 2187   49 ]
1371
+C  [3763 3289   21   97 1374 1182 1624  920  285  210 3815 3316   30  118 ]
1372
+G  [ 255   22 1125 3945  105  254  618 1032  781 1269  224   12 1247 3886 ]
1373
+T  [  40  477  508   13 1890 2248 1135  677  441  996   34  503  612   17 ]
1374
+
1375
+>MA0145.2	Tcfcp2l1
1376
+A  [   8  285 2437   24  710  402  707 1462 2585 1612   16  253 2199   49 ]
1377
+C  [3768 3304   21   98 1380 1183 1630  922  286  212 3811 3324   30  118 ]
1378
+G  [ 255   22 1117 3949  103  253  616 1026  780 1263  223   12 1232 3881 ]
1379
+T  [  40  465  507   12 1890 2246 1134  681  441 1003   34  491  612   17 ]
1380
+
841 1381
 >MA0145.3	TFCP2
842 1382
 A  [339 575 575   1   5 129   1 189  46  96 ]
843 1383
 C  [ 61   6   2 575 575   3   9  35  60 196 ]
844 1384
 G  [129  24   8   2   1 575 575   0  20  31 ]
845 1385
 T  [ 47  32 102   0 119   7   1 575 575 252 ]
846 1386
 
1387
+>MA0146.1	Zfx
1388
+A  [ 50  60  91  72  10   6  30 191   9   0   1   0   0  84 ]
1389
+C  [177 170 151  49 297 362 125 154   2   3 480 480   2 122 ]
1390
+G  [179 172 199 298 144   2 182 121 469 477   0   0   0 219 ]
1391
+T  [ 70  75  37  60  30 111 144  15   1   1   0   1 479  56 ]
1392
+
847 1393
 >MA0146.2	Zfx
848 1394
 A  [ 50  59  91  72  10   6  30 191   8   0   0   0   0  84 ]
849 1395
 C  [178 170 151  49 297 361 124 153   2   3 481 480   1 122 ]
850 1396
 G  [179 173 199 297 144   2 183 122 470 477   0   0   0 218 ]
851 1397
 T  [ 70  75  37  61  30 112 144  15   1   1   0   1 480  56 ]
852 1398
 
1399
+>MA0147.1	Myc
1400
+A  [ 67  34   8 217   0  19   9   0   0  45 ]
1401
+C  [ 96  53 219   4 212   2  44   2  17 107 ]
1402
+G  [ 36 130   0   5   3 204   0 216 183  24 ]
1403
+T  [ 28  10   0   1  12   2 174   9  27  51 ]
1404
+
853 1405
 >MA0147.2	Myc
854 1406
 A  [1181    0 5335    0    0    0    0   49  848   82 ]
855 1407
 C  [3650 5335    0 2295    0    0    0 2297 1087 1877 ]
856 1408
 G  [ 504    0    0    0 5335    0 5335 2081  556  801 ]
857 1409
 T  [   0    0    0 3040    0 5335    0  908 2844 2575 ]
858 1410
 
1411
+>MA0148.1	FOXA1
1412
+A  [ 13 108   1   5   6 476   6 291  45 378  90 ]
1413
+C  [  2   7   7   7   3  12 807 106 368   9 125 ]
1414
+G  [  2 770   5  24  78 368   5   5  69  24 466 ]
1415
+T  [875   8 882 860 809  40  79 495 414 482 211 ]
1416
+
1417
+>MA0148.2	FOXA1
1418
+A  [ 13 108   1   4   6 478   4 289  42 379  89 ]
1419
+C  [  1   7   7   7   3  12 808 106 369   7 125 ]
1420
+G  [  2 772   4  24  77 368   5   5  69  24 467 ]
1421
+T  [876   7 885 862 811  38  79 496 414 482 211 ]
1422
+
859 1423
 >MA0148.3	FOXA1
860 1424
 A  [ 4328  4659  3062  7135    70  5883     0     0     0 18252     0  9193   827 10702  4807 ]
861 1425
 C  [ 4827  6851  8558  4317     0     0     0     0     0     0 20556  2655  7296     1  2603 ]
... ...
@@ -868,6 +1432,12 @@ C  [  0   0   0   0   0   0   0   0   0   2   4   0   0   2   3   0   0   3 ]
868 1432
 G  [105 103   1   1 104 102   2   3 104 103   2   0 105 103   0   2  97  97 ]
869 1433
 T  [  0   0   0   0   0   1   0   0   1   0   0   0   0   0   2   1   3   2 ]
870 1434
 
1435
+>MA0150.1	NFE2L2
1436
+A  [10  0  0 20  0  6  5 16  0  0 15 ]
1437
+C  [ 1  0  0  0 17  2 10  0  0 20  2 ]
1438
+G  [ 9  0 19  0  1  1  1  2 20  0  2 ]
1439
+T  [ 0 20  1  0  2 11  4  2  0  0  1 ]
1440
+
871 1441
 >MA0150.2	Nfe2l2
872 1442
 A  [166 401 118 203 488   0   0 726  20  84  65 577  10   4 623 ]
873 1443
 C  [338  78 239 247  28   0   0   0 533  20 549   3  11 699  26 ]
... ...
@@ -886,12 +1456,30 @@ C  [ 1  2  1  0 25 26  3 ]
886 1456
 G  [ 2  2  0  0  0  0  1 ]
887 1457
 T  [20 21 24 26  0  0  4 ]
888 1458
 
1459
+>MA0153.1	HNF1B
1460
+A  [0 0 8 7 0 5 3 0 0 8 9 0 ]
1461
+C  [3 3 1 1 0 0 0 0 0 0 0 8 ]
1462
+G  [0 0 0 1 0 4 1 1 0 1 0 0 ]
1463
+T  [6 6 0 0 9 0 5 8 9 0 0 1 ]
1464
+
889 1465
 >MA0153.2	HNF1B
890 1466
 A  [ 1528   541  5730 30839 30839  1944  6502 30839  1323    80 30839 30839  1790 ]
891 1467
 C  [ 1030  2552  3466    13  1163   809  9236    73   416   665   794  1472 17114 ]
892 1468
 G  [30839  1434   778   398   140    66  9626   600  1589     1  5271  1980   725 ]
893 1469
 T  [ 1628 30839 30839    49   612 30839  5474  1047 30839 30839  3119   406 13724 ]
894 1470
 
1471
+>MA0154.1	EBF1
1472
+A  [11  0  1  2 11 16  0  2  0 21 ]
1473
+C  [ 9 22 16 20  9  1  0  0  0  0 ]
1474
+G  [ 2  0  1  0  0  5 25 23 25  4 ]
1475
+T  [ 3  3  7  3  5  3  0  0  0  0 ]
1476
+
1477
+>MA0154.2	EBF1
1478
+A  [ 4513     0     0   886     0  9191 21366  1085  8427     0 22124 ]
1479
+C  [ 7097 10267 33855 22776 33781 22317     0     0     0     0  2891 ]
1480
+G  [12581  2643     0     0     0     0     0 32770 25294 33855  7215 ]
1481
+T  [ 9664 20945     0 10193    74  2347 12489     0   134     0  1625 ]
1482
+
895 1483
 >MA0154.3	EBF1
896 1484
 A  [1110  257   37    0    3    0  562  777   21  107    6 1544  604  250 ]
897 1485
 C  [ 115  276  232 1544 1544 1544  391   77    6    8    0   17  586  364 ]
... ...
@@ -904,12 +1492,24 @@ C  [ 0  0  8 15  0  0  1  0  0  2 16  0 ]
904 1492
 G  [ 4 20  3  0  0 24 23 24 24 16  0 12 ]
905 1493
 T  [19  4 13  3  8  0  0  0  0  6  5  2 ]
906 1494
 
1495
+>MA0156.1	FEV
1496
+A  [ 2  9  0  0 13 12  7  0 ]
1497
+C  [ 9  3  0  0  0  0  0  0 ]
1498
+G  [ 1  1 13 13  0  0  6  0 ]
1499
+T  [ 1  0  0  0  0  1  0 13 ]
1500
+
907 1501
 >MA0156.2	FEV
908 1502
 A  [7249 1165  614   13    2 7249 7249 3318  444 2134 ]
909 1503
 C  [ 574 7249 7249    0    1   11  154  366 1821 1358 ]
910 1504
 G  [1555  718   51 7249 7249    3    6 7249  624 2257 ]
911 1505
 T  [1629  243    3    2    9   18 2196   92 7249 1499 ]
912 1506
 
1507
+>MA0157.1	FOXO3
1508
+A  [ 0  1  3 13 12 13  0 12 ]
1509
+C  [ 0  2  0  0  1  0 12  0 ]
1510
+G  [ 5 10  1  0  0  0  0  0 ]
1511
+T  [ 8  0  9  0  0  0  1  1 ]
1512
+
913 1513
 >MA0157.2	FOXO3
914 1514
 A  [ 21   0 532 532 532  15 532 317 ]
915 1515
 C  [  0   0  16   1  10 532  11  12 ]
... ...
@@ -940,6 +1540,12 @@ C  [1832   67   67   88 5364  981 ]
940 1540
 G  [ 176  300 6713 6643  160 1186 ]
941 1541
 T  [4546 6464   51   90  162 1447 ]
942 1542
 
1543
+>MA0162.1	Egr1
1544
+A  [ 3  2  0  0  0  3  1  0  2  0  1 ]
1545
+C  [ 4  1 13  0  0  0  0  0 10  0  0 ]
1546
+G  [ 1 12  0 15  3 12 14 15  0 15  7 ]
1547
+T  [ 7  0  2  0 12  0  0  0  3  0  7 ]
1548
+
943 1549
 >MA0162.2	EGR1
944 1550
 A  [ 1098  1506  1160  1335   233  2911     0     0     0  3652     0  2368     0  3026 ]
945 1551
 C  [ 5728  6847  6049 10431 11574     0 12256 11852 10154  8361 11952     0  9849  5595 ]
... ...
@@ -1150,6 +1756,12 @@ C  [ 5  0  0  0  0  0  0 ]
1150 1756
 G  [ 1  0  2  0  5  7 22 ]
1151 1757
 T  [24 35  0  0 26 22  0 ]
1152 1758
 
1759
+>MA0197.1	nub
1760
+A  [ 2  8  1 22 22  0  2 15 ]
1761
+C  [ 4  3  0  0  0  0  3  1 ]
1762
+G  [ 7  0  0  0  0  0  6  1 ]
1763
+T  [ 9 11 21  0  0 22 11  5 ]
1764
+
1153 1765
 >MA0197.2	nub
1154 1766
 A  [ 2 29  0  0  0 24 28 28  4  6 19  4 ]
1155 1767
 C  [ 1  0  0  0 19  0  0  0  1  5  5  3 ]
... ...
@@ -1264,6 +1876,12 @@ C  [ 1  0  0  0  1  0  0 ]
1264 1876
 G  [ 4  0  1  0  0 15  3 ]
1265 1877
 T  [13 23  0  0 22  8  1 ]
1266 1878
 
1879
+>MA0216.1	cad
1880
+A  [ 3  1  8 37  3  3 18 ]
1881
+C  [ 2  0  0  0  0  0  0 ]
1882
+G  [ 3  0  2  1  0  9 19 ]
1883
+T  [30 37 28  0 35 26  1 ]
1884
+
1267 1885
 >MA0216.2	cad
1268 1886
 A  [ 854  575    0  745 2117    0 2236 2303 2303 1637 1046 ]
1269 1887
 C  [   0  341 1481 1475    0   95    0    0    0  115  755 ]
... ...
@@ -1384,6 +2002,12 @@ C  [ 6  1  0  0  0  1  0 ]
1384 2002
 G  [ 2  0  0  0  0  4  3 ]
1385 2003
 T  [11 19  0  0 20 15  2 ]
1386 2004
 
2005
+>MA0237.1	pan
2006
+A  [ 4  2  2  2  0 17  8  7 ]
2007
+C  [10  3  0  0  2  0  0 11 ]
2008
+G  [ 3  0  1  0 20  5  0  3 ]
2009
+T  [ 8 20 22 23  3  3 17  4 ]
2010
+
1387 2011
 >MA0237.2	pan
1388 2012
 A  [ 0  0  0  0  7 11  7  0  0  0  0 11 34 22 ]
1389 2013
 C  [ 0 71  0 20 43 10 40 30  0  0  0  9  0  0 ]
... ...
@@ -1444,6 +2068,12 @@ C  [ 0  0  0  0  0 10 ]
1444 2068
 G  [ 1 27  0  1  0  0 ]
1445 2069
 T  [26  0  0 26  0  3 ]
1446 2070
 
2071
+>MA0247.1	tin
2072
+A  [ 0  1  0 16 16  0  0  3 ]
2073
+C  [ 9  0 11  0  0  0  0  0 ]
2074
+G  [ 3  0  1  0  0 16  0 13 ]
2075
+T  [ 4 15  4  0  0  0 16  0 ]
2076
+
1447 2077
 >MA0247.2	tin
1448 2078
 A  [136   0   0   0 326 515   0   0   0  13 ]
1449 2079
 C  [ 54 188  51 425   0   0   0   0   0 157 ]
... ...
@@ -1510,6 +2140,12 @@ C  [ 7  0  0  0  1  0  0 ]
1510 2140
 G  [ 5  0  0  0  0 10  4 ]
1511 2141
 T  [11 25  0  0 25 16  0 ]
1512 2142
 
2143
+>MA0258.1	ESR2
2144
+A  [ 78 158 186  27  18  13   0 337  49  64  52  21  63 178  34  46  27  60 ]
2145
+C  [161  51  15   0  20  19 357   1 123  63  61  33  25  99 268 289  90  94 ]
2146
+G  [ 63  41 154 275 319  33   0   0 113 149 147  24 265  19   2   0   0 136 ]
2147
+T  [ 55 107   2  55   0 292   0  19  72  81  97 279   4  61  53  22 240  67 ]
2148
+
1513 2149
 >MA0258.2	ESR2
1514 2150
 A  [5410  429   59   74    0 8098  502 2092 1808 1602 1121 3278  434 1111  834 ]
1515 2151
 C  [  96    0    0  147 7621    1 4202 3235 2510  975  398 2056 6469 5854 2708 ]
... ...
@@ -1924,6 +2560,12 @@ C  [  0 203   0 203   0   0   0 ]
1924 2560
 G  [101   0   0   0   0   0   0 ]
1925 2561
 T  [  0   0   0   0   0   0 203 ]
1926 2562
 
2563
+>MA0328.1	MATALPHA2
2564
+A  [ 0  9  0  0  0 10  9  4  0 ]
2565
+C  [10  0  0  0  0  0  1  0  0 ]
2566
+G  [ 0  2  0 11  0  0  0  0  0 ]
2567
+T  [ 1  0 11  0 11  1  1  7 11 ]
2568
+
1927 2569
 >MA0328.2	MATALPHA2
1928 2570
 A  [   0  455    0   26    0  910  639  394 ]
1929 2571
 C  [ 815    0   62    0    0    0   72   28 ]
... ...
@@ -2662,6 +3304,12 @@ C  [ 1  1  0  9  4  0  0  0  3 26  0 12 ]
2662 3304
 G  [ 2  0  0  6  1  5 26  8 18  0  1  7 ]
2663 3305
 T  [ 4  0 10  6 21  0  0  1  4  0  0  2 ]
2664 3306
 
3307
+>MA0452.1	Kr
3308
+A  [ 3 11 24 30 18  0  2  2  0  4 20 ]
3309
+C  [17  4  0  0  6  0  0  0  1  0  4 ]
3310
+G  [ 5 10  7  0  7 31 29 29  7  5  3 ]
3311
+T  [ 6  6  0  1  0  0  0  0 23 22  4 ]
3312
+
2665 3313
 >MA0452.2	Kr
2666 3314
 A  [ 179  205  151 1248 1080   11    0    0    0    0    0  113  318  211 ]
2667 3315
 C  [ 422  189  386    0  216 1170 1177 1296  202    0  113  399  322  434 ]
... ...
@@ -2704,6 +3352,12 @@ C  [ 8  0  0  0  0  5  0  0  5 ]
2704 3352
 G  [ 3  0 22 22  0  0  0  0  3 ]
2705 3353
 T  [ 1  0  0  0  0 17  1  0 13 ]
2706 3354
 
3355
+>MA0461.1	Atoh1
3356
+A  [   0 7714    0 4249 1557    0    0    0 ]
3357
+C  [7714    0    0 3465    0    0    0 4780 ]
3358
+G  [   0    0 7714    0    0 7714 7714    0 ]
3359
+T  [   0    0    0    0 6157    0    0 2934 ]
3360
+
2707 3361
 >MA0461.2	Atoh1
2708 3362
 A  [ 655  523   42 1027   17 1027   22    2   34  128 ]
2709 3363
 C  [ 108  334 1027   20   10   74    4    1  234  494 ]
... ...
@@ -2722,6 +3376,12 @@ C  [171  22  80 876 819   0  86   0   0 101   7  92 494 188 ]
2722 3376
 G  [245  28  30  24   0   0 404 814  11 175 213 630 116 166 ]
2723 3377
 T  [349 871 841  26 137 956  20   0   4  38 121 133 157 233 ]
2724 3378
 
3379
+>MA0464.1	Bhlhe40
3380
+A  [ 1626  4869     0 15804     0  2875     0     0  3859  6629  2028 ]
3381
+C  [ 6868   524 15804     0 14493  1107     0     0 11919  4255  6293 ]
3382
+G  [ 6311  3146     0     0     0 11822     0 15804    26   345  3681 ]
3383
+T  [  999  7265     0     0  1311     0 15804     0     0  4575  3802 ]
3384
+
2725 3385
 >MA0464.2	BHLHE40
2726 3386
 A  [ 3824  1391    59 11222    23    66   167     4  5927  1544 ]
2727 3387
 C  [ 3025   481 11222   130 11222    30   248    12  5295  5706 ]
... ...
@@ -2734,6 +3394,12 @@ C  [ 319    8  136 1048  832    0    0    0    0    0  150 ]
2734 3394
 G  [ 480  502 1153    0    0    0    0    0    0    0  313 ]
2735 3395
 T  [ 185  422    0  549   68    0 1597    0    0    0  121 ]
2736 3396
 
3397
+>MA0466.1	CEBPB
3398
+A  [13006 75198     0     0  4556     0 74715  8654 60151 99494     0 ]
3399
+C  [10026  5868     0     0     0 99494  5478 51954 39343     0 36038 ]
3400
+G  [33617 18428     0     0 75531     0 10015     0     0     0  2043 ]
3401
+T  [42845     0 99494 99494 19407     0  9286 38886     0     0 61413 ]
3402
+
2737 3403
 >MA0466.2	CEBPB
2738 3404
 A  [10585    33    17 10930   393  3521  2527 22732 22732   155 ]
2739 3405
 C  [ 5007    34    14    34 22732   555 22732   636     9 10617 ]
... ...
@@ -2752,6 +3418,12 @@ C  [ 2495     0     0 11675 16478 13951  2889     0     0 37408     0 ]
2752 3418
 G  [  979  1216     0  2002  4981  6127     0     0     0     0     0 ]
2753 3419
 T  [27446     0     0 19312 16758 18139    50     0 38217   809  4419 ]
2754 3420
 
3421
+>MA0469.1	E2F3
3422
+A  [   0    0    0    0    0    0    0    0  365  275  196  811  109  441  305 ]
3423
+C  [1400    0 2549 2469 2549    0 2549 1703 1327  903 1495  329 1075  640  718 ]
3424
+G  [   0    0    0   80    0 2240    0  607  397  742  556  512  582  200  644 ]
3425
+T  [1149 2549    0    0    0  309    0  239  460  629  302  274  160  645  259 ]
3426
+
2755 3427
 >MA0469.2	E2F3
2756 3428
 A  [1369 1917 2202 2309 2207  740   53    0    0    0    0   97 2024 1399 1093  437   74  287 ]
2757 3429
 C  [ 284   46    0    0    0    0  520    3 2490    3 2429 2411  653   30   10   24  429  712 ]
... ...
@@ -2770,24 +3442,48 @@ C  [  80  406    0 1954    0    0   29    0    0  454  706 ]
2770 3442
 G  [1406 1909 2757    0 2750 2757 2708    0 1071 1135  909 ]
2771 3443
 T  [ 459    0    0  131    0    0    0    0    0  180  371 ]
2772 3444
 
3445
+>MA0472.1	EGR2
3446
+A  [ 169  337  168  387   26  448    0  152    0 1059    0  460    0  558  127 ]
3447
+C  [ 572  460  572  722 1186    0 1246 1094 1169  187 1246    0 1041  302  617 ]
3448
+G  [ 291  180  216   65    0  602    0    0    0    0    0  579  114  199  251 ]
3449
+T  [ 214  269  290   72   34  196    0    0   77    0    0  207   91  187  251 ]
3450
+
2773 3451
 >MA0472.2	EGR2
2774 3452
 A  [1157    0  295    6   24    0 2147    0  106    4 1731 ]
2775 3453
 C  [ 679 1551    0 1558 1554 1468  110 1573    0 1585  157 ]
2776 3454
 G  [  94   28 3731   25   15   38   26    2 4034   20  542 ]
2777 3455
 T  [ 142   73  222   29   13  277    2   23  171  115  430 ]
2778 3456
 
3457
+>MA0473.1	ELF1
3458
+A  [ 4134  6990  7978  4086   924  8929     0     0 13518 13518  1183  1571  2634 ]
3459
+C  [ 2167  1502  1207  4589 10007  4589     0     0     0     0     0  2094  1735 ]
3460
+G  [ 5587  3563  2318  3111  2587     0 13518 13518     0     0 12335   179  8125 ]
3461
+T  [ 1630  1463  2015  1732     0     0     0     0     0     0     0  9674  1024 ]
3462
+
2779 3463
 >MA0473.2	ELF1
2780 3464
 A  [3447 3447  625   98  116    0    0 3447 3447  539   34 1042 ]
2781 3465
 C  [ 515  342 3447 3447 3447    0    0    0    1    0  299  656 ]
2782 3466
 G  [ 880  160  301  257    0 3447 3447    6    0 3447    0 1354 ]
2783 3467
 T  [1042  566  314    0    0    0    0    0   59    1 3447  394 ]
2784 3468
 
3469
+>MA0474.1	Erg
3470
+A  [ 9430  1473 16007     0     0 16727 16580  3244  1570  4953  4558 ]
3471
+C  [  231 10483   693     0     0     0     0     0  4038  1498  2474 ]
3472
+G  [ 5874  4736    27 16727 16727     0     0 13483  2146  8204  8042 ]
3473
+T  [ 1192    35     0     0     0     0   147     0  8973  2072  1653 ]
3474
+
2785 3475
 >MA0474.2	ERG
2786 3476
 A  [4566  646  635    1    0 4566 4566 1990  137 1006 ]
2787 3477
 C  [ 268 4566 4566    0    1   20  119  100 1586 1100 ]
2788 3478
 G  [ 848  398   22 4566 4566    0    7 2576  355 1668 ]
2789 3479
 T  [ 928   97    6    0   29    7 1245   28 4566  792 ]
2790 3480
 
3481
+>MA0475.1	FLI1
3482
+A  [1830  295 2712    0    0 3667 3520  620   95  850 1014 ]
3483
+C  [ 205 2815  955    0    0    0    0    0 1001  300  462 ]
3484
+G  [1432  557    0 3667 3667    0    0 3047  300 2130 1875 ]
3485
+T  [ 200    0    0    0    0    0  147    0 2271  387  316 ]
3486
+
2791 3487
 >MA0475.2	FLI1
2792 3488
 A  [43586  2926  2806     5     0 43586 43586 19102   897 10642 ]
2793 3489
 C  [ 1460 43586 43586     0     0    21   230   563 11173  7716 ]
... ...
@@ -2854,6 +3550,12 @@ C  [110 171 605 468   3   9  84   0   6   0 715  72 329 ]
2854 3550
 G  [401 536  40   1 205   0  35   0   0   0   5   6 160 ]
2855 3551
 T  [139  66 152 192  16 876  21   4   0 867 117 240 255 ]
2856 3552
 
3553
+>MA0486.1	HSF1
3554
+A  [ 25   8   3   1   4 128   0 187 186  44  39  13   8   0   6 ]
3555
+C  [ 82  26  11 222  71   7   0  24   6  63  62  16   5 218  88 ]
3556
+G  [ 56  12   8   2   6  89 225   3  15  73  67   9   4   2  18 ]
3557
+T  [ 62 179 203   0 144   1   0  11  18  45  57 187 208   5 113 ]
3558
+
2857 3559
 >MA0486.2	HSF1
2858 3560
 A  [  64   11    9    4 1455    0 1455 1455   70  490   25    6    3 ]
2859 3561
 C  [  18    4 1455  361  424    0    8    4  713  190    5    2 1455 ]
... ...
@@ -2920,6 +3622,12 @@ C  [ 321  151  196 1412  985  256   32    0    0    0   62    0  120  836  450 ]
2920 3622
 G  [ 676  573  822   78    0   74  241   87    2    4    0   32 1671  148  126 ]
2921 3623
 T  [ 507  752  760  337 1224  263  230   15   76   70 2091    0   29  250  624 ]
2922 3624
 
3625
+>MA0498.1	Meis1
3626
+A  [1341  171  121    0    0   85    0 2458  261  334  175 1059  515  472  529 ]
3627
+C  [ 122  759 2411    0    0   50 2607    0 1115  537 1472  547  802 1007  736 ]
3628
+G  [ 499 1414    3    0 2607    0    0    0 1075  263  494  145  696  536  480 ]
3629
+T  [ 645  263   72 2607    0 2472    0  149  156 1473  466  856  594  592  862 ]
3630
+
2923 3631
 >MA0498.2	MEIS1
2924 3632
 A  [23727  8690     0 77159     0 77159 17224 ]
2925 3633
 C  [18797  5575  1249  2903 77159     0 14864 ]
... ...
@@ -2992,18 +3700,36 @@ C  [ 157  222  833  433 1748 2048  402  115    0    0 1710    0    0 2138 ]
2992 3700
 G  [1532  377  131  762   96    0   73   96 1534 1952   12  244   56    0 ]
2993 3701
 T  [ 159 1481 1029  522  257   90  409 1789    0    0  129  101    0    0 ]
2994 3702
 
3703
+>MA0510.1	RFX5
3704
+A  [ 343  595    6  181 1189    0 1844  245    0 3057 3692    0 2084  956  871 ]
3705
+C  [1572  796 1870 3687 2171  832    1    0 2815  497  176 3868  782  361 1388 ]
3706
+G  [ 561  862 1283    0   61    0 2023 3514  408  314    0    0    0 2184 1239 ]
3707
+T  [1392 1615  709    0  447 3036    0  109  645    0    0    0 1002  367  370 ]
3708
+
2995 3709
 >MA0510.2	RFX5
2996 3710
 A  [ 277   90    4   47  821    3    1 2146  144  760  143  139 2166 2206   26  462 ]
2997 3711
 C  [1075    0   33   98   81 2378 2118   42   56   11   48 1613   10   21 2379  890 ]
2998 3712
 G  [ 790 2819   15   10 1675   38    7   47   22 2266 2664   61   99   16   12  905 ]
2999 3713
 T  [ 490    9 2902 2842  142   69  725  188 2872    8    0  882   46    9   67  286 ]
3000 3714
 
3715
+>MA0511.1	RUNX2
3716
+A  [  99  165  151  121  124   75    9    0   15    0    0    0   42  258  126 ]
3717
+C  [ 133  119   79  172  155  392    4    1    3    0    0  132  190    8  126 ]
3718
+G  [ 443  444  426  477  245  133   11 1030    0 1062 1060   90  158  143  462 ]
3719
+T  [ 387  334  406  292  538  462 1038   31 1044    0    2  840  672  653  348 ]
3720
+
3001 3721
 >MA0511.2	RUNX2
3002 3722
 A  [3872 6621 6621    0    0 1914    0 6621 4202 ]
3003 3723
 C  [1092  556  325 6621 6621   36 6621  476  677 ]
3004 3724
 G  [ 326 1215    0    0    0 4707    0  458 1134 ]
3005 3725
 T  [2748  582    0    0    0  120    0  191  607 ]
3006 3726
 
3727
+>MA0512.1	Rxra
3728
+A  [ 278 4154 2623 4877    0    0    0    0 5348 1150 1640 ]
3729
+C  [4521  418  252    0    0    0  583 5348    0 1070  742 ]
3730
+G  [ 305    9 2473  471 5348 3882  643    0    0 2336 1569 ]
3731
+T  [ 244  767    0    0    0 1466 4122    0    0  792 1397 ]
3732
+
3007 3733
 >MA0512.2	Rxra
3008 3734
 A  [12568 21345   110   132    47    97 46204 45275 45265    39    63    44    63 44403 ]
3009 3735
 C  [ 5031   200    77    72   109 44342    51    89    73    71    85   114 43686   158 ]
... ...
@@ -3064,6 +3790,12 @@ C  [ 1585   124 12895     0     0 10822     0     0  5527  2416  3005 ]
3064 3790
 G  [ 5123  3951     0     0 12887  1889     0 12895  3811  2925  4836 ]
3065 3791
 T  [   17     0     0     0     0     0 12895     0  1682  3642  2191 ]
3066 3792
 
3793
+>MA0522.1	Tcf3
3794
+A  [ 2717  8100     0 17261     0     0     0     0     0  6957  2351 ]
3795
+C  [ 8489  6433 17261     0  4101 16850     0     0 12529  4204  4115 ]
3796
+G  [ 4689  1756     0     0 12403   411     0 17261  3397    96  6625 ]
3797
+T  [ 1366   972     0     0   757     0 17261     0  1335  6004  4170 ]
3798
+
3067 3799
 >MA0522.2	TCF3
3068 3800
 A  [2823 3423    0 7799    0    0   43   27  253 2066 ]
3069 3801
 C  [2123 1321 7799    5 7799 7799   35   21 3014 1393 ]
... ...
@@ -3076,12 +3808,24 @@ C  [ 756  840  136 1947   26    0 3304    0   15    0   37  849 1123  826 ]
3076 3808
 G  [1140 1153  559 2008    0    0  729    0   70   19 3848 2008 1210  757 ]
3077 3809
 T  [ 767  387  423  148 1367 4050    0    0    0    0    0  296  457  823 ]
3078 3810
 
3811
+>MA0524.1	TFAP2C
3812
+A  [ 4801  6477  2550  4918   421     0     0     0  1082 16442   191     0   285  4343  8905 ]
3813
+C  [ 6752  4693  4943  2009  6040 18426 14817  9317 14790     0     0     0  7908  9235  3259 ]
3814
+G  [ 2123  3347  2643  6098 11033     0     0  1237  1768  1195 18235 18426 10222  1788  2536 ]
3815
+T  [ 4750  3909  8290  5401   932     0  3609  7872   786   789     0     0    11  3060  3726 ]
3816
+
3079 3817
 >MA0524.2	TFAP2C
3080 3818
 A  [1289  878   70   24   37  516 2405 2216  163  111  254 3485 ]
3081 3819
 C  [1427 1693 5834 5834 3594 2124 1450  341   12  742 5834  389 ]
3082 3820
 G  [ 308 5834  621    9  384 1327 1702 3261 5834 5834 1172 1035 ]
3083 3821
 T  [2810  139   51  121 1820 1867  277   17   16   37  599  925 ]
3084 3822
 
3823
+>MA0525.1	TP63
3824
+A  [3613 2402 4027   19 6536 2926   82  896 2058  437 5045 2812 4726    0 5101  953  225  528 2379 1446 ]
3825
+C  [1752 1337  544 9153 1640  255    0 4400 4119 7000 2050  989  198 9632 1856  817    0 5454 4089 3775 ]
3826
+G  [2372 3599 3802  102  616 1263 9550   74  998 1417  208 4555 3530    0   66  695 9394  213  408 1621 ]
3827
+T  [1895 2294 1259  358  840 5188    0 4262 2457  778 2329 1276 1178    0 2609 7167   13 3437 2756 2790 ]
3828
+
3085 3829
 >MA0525.2	TP63
3086 3830
 A  [1586 2261    0 2246  692    0   14   97  649  112  993 2192    0 2151   75    0   49  701 ]
3087 3831
 C  [  26    1 2533    0   33    0   85 1025  478  681    1    0 2788    0  617    0  202 2099 ]
... ...
@@ -3472,6 +4216,12 @@ C  [ 14  36  41  16   1   0   0  94   0 107   1   1 114   4  42 ]
3472 4216
 G  [ 41  46  54  32   0 107   0  20   4   2   3 113   0   6  38 ]
3473 4217
 T  [ 14  18   4   0 111   7   1   0 109   0   2   0   0   6  22 ]
3474 4218
 
4219
+>MA0592.1	ESRRA
4220
+A  [ 17  18 200 198   0   0   6   0 197  23  70 ]
4221
+C  [118 174   2   0   0   0   0 205   1 108  54 ]
4222
+G  [ 11  15   6  10 203 207  22   3  10  44  40 ]
4223
+T  [ 62   1   0   0   5   1 180   0   0  33  44 ]
4224
+
3475 4225
 >MA0592.2	Esrra
3476 4226
 A  [ 110  131   33 4775 4775    1    0    6    0 4775  739 ]
3477 4227
 C  [ 696  339 4775    0    0    3    2   11 4775    6  350 ]
... ...
@@ -3508,6 +4258,12 @@ C  [ 93  47   0 182 195 136  17  71  34 ]
3508 4258
 G  [ 27  12 137   0   0   1  77  41  17 ]
3509 4259
 T  [ 61 125  42  10   1   4  58  57  32 ]
3510 4260
 
4261
+>MA0598.1	EHF
4262
+A  [ 703    0    0    0    0    0    0    0 ]
4263
+C  [ 724 1427    0    0 1427 1427    0  707 ]
4264
+G  [   0    0    0    0    0    0    0  720 ]
4265
+T  [   0    0 1427 1427    0    0 1427    0 ]
4266
+
3511 4267
 >MA0598.2	EHF
3512 4268
 A  [ 461  895  171  125  166    2    0  942  942  197   36  708 ]
3513 4269
 C  [ 175   34 1224 1280 1288    1    0    4   10   29   73  119 ]
... ...
@@ -3520,6 +4276,12 @@ C  [ 2023 11900 12008  9569 13611     0 13611 13611 13135  5595 ]
3520 4276
 G  [ 7572     0     0     0     0  5182     0     0     0     0 ]
3521 4277
 T  [ 2587  1711  1603   565     0  3378     0     0   476  4101 ]
3522 4278
 
4279
+>MA0600.1	RFX2
4280
+A  [ 373   62  192  431   34    1 1567  164  581  193  214 2095 2312    0  760  588  406  585  620 ]
4281
+C  [ 141  184  736  317 1936 2162  432  222    0    5 1932    8    0 2294  784  403  831  630  668 ]
4282
+G  [1716  317   64  910  121    7   41   94 1765 2146    0  170   28    0  539 1178  733  761  678 ]
4283
+T  [ 116 1783 1354  688  255  176  306 1866    0    2  200   73    6   52  263  177  376  370  380 ]
4284
+
3523 4285
 >MA0600.2	RFX2
3524 4286
 A  [ 1381   270    28  1990  3948    12     2  9773   215  3132  2007  1359  9266  9876     7  2415 ]
3525 4287
 C  [ 5653    12    38   888   237 13197 12326    38    88     7   128  8298    26    14 14067  3654 ]