Name Mode Size
..
runTests.R 100755 1 kb
runit.alignReads.R 100644 2 kb
runit.analyzeVariants.R 100755 9 kb
runit.bamUtils.R 100755 1 kb
runit.buildGenomicFeatures.R 100644 1 kb
runit.calculateCoverage.R 100755 4 kb
runit.checkConfig.R 100755 2 kb
runit.config.R 100755 6 kb
runit.detectAdapterContam.R 100755 3 kb
runit.detectRRNA.R 100755 4 kb
runit.filterQuality.R 100755 2 kb
runit.gatk.R 100755 8 kb
runit.io.R 100644 7 kb
runit.mergeLanes.R 100644 2 kb
runit.picard.R 100755 1 kb
runit.preprocessReads.R 100644 3 kb
runit.readRNASeqEnds.R 100644 2 kb
runit.reportPipelineQA.R 100755 2 kb
runit.runPipeline.R 100755 1 kb
runit.targetLengths.R 100755 1 kb
runit.tools.R 100755 2 kb
runit.trimReads.R 100755 3 kb