Name Mode Size
..
TP53GenomicFeatures.R 100755 2 kb
alignReads.R 100644 9 kb
analyzeVariants.R 100755 12 kb
bamUtils.R 100755 6 kb
buildGenomicFeaturesFromTxDb.R 100755 4 kb
checkConfig.R 100644 17 kb
config.R 100644 7 kb
countGenomicFeatures.R 100755 9 kb
coverage.R 100755 9 kb
createSummaryCounts.R 100755 2 kb
detectAdapterContam.R 100755 7 kb
detectRRNA.R 100755 4 kb
filterQuality.R 100755 5 kb
gatk.R 100755 8 kb
initPipeline.R 100755 6 kb
io.R 100644 19 kb
logging.R 100755 2 kb
mergeLanes.R 100644 7 kb
picard.R 100644 4 kb
preprocessReads.R 100755 11 kb
reportPipelineQA.R 100755 26 kb
runPipeline.R 100755 4 kb
summaries.R 100644 23 kb
targetLengths.R 100755 2 kb
testHelpers.R 100644 5 kb
tools.R 100644 14 kb
trimReads.R 100755 2 kb
wrapGsnap.R 100755 3 kb
zzz.R 100755 0 kb